结论前置：针对您提出的“村里一户一宅政策合法确权给母亲的宅基地，爷爷拒绝配合过户房屋所有权证”的问题，核心在于解决房屋所有权证过户的障碍，具体可从以下角度分析和处理。

1. 确认宅基地使用权与房屋所有权的法律关系

首先，需要明确的是，宅基地使用权与房屋所有权是两个不同的法律概念。宅基地使用权通常基于农村集体经济组织成员的身份而取得，具有无偿性、长期性和福利性。而房屋所有权则是指对房屋本身的占有、使用、收益和处分的权利。在“一户一宅”政策下，宅基地使用权通常确权给符合条件的家庭成员，而房屋所有权则可能因建造、继承等因素归属于特定个人。

2. 分析爷爷拒绝配合过户的可能原因

爷爷拒绝配合过户房屋所有权证，可能出于多种原因，如情感因素、对法律政策的不理解、对房屋价值的考量等。在处理此类问题时，应首先尝试与爷爷进行沟通，了解其真实想法和顾虑，并尝试通过协商、调解等方式解决分歧。

3. 探讨法律途径解决过户问题

若沟通无果，可考虑通过法律途径解决过户问题。具体步骤如下：

• 收集证据：收集能够证明房屋所有权归属的证据，如建造证明、继承证明、分家协议等。同时，收集宅基地使用权确权给母亲的相关文件，以证明宅基地使用权的合法性。
• 提起诉讼：若爷爷拒绝配合过户，且协商、调解无果，可向人民法院提起诉讼，请求确认房屋所有权归属，并判令爷爷协助办理房屋所有权证过户手续。
• 执行判决：若法院判决支持您的诉求，而爷爷仍拒绝履行判决，可向法院申请强制执行，由法院依法采取强制措施，完成房屋所有权证的过户。

4. 注意事项

• 尊重法律程序：在处理此类问题时，应严格遵守法律程序，不得采取非法手段迫使爷爷配合过户。
• 保持理性沟通：在沟通过程中，应保持理性、平和的态度，避免情绪化行为导致矛盾升级。
• 寻求专业帮助：若对法律程序不熟悉或遇到复杂情况，可寻求专业律师的帮助，以确保问题得到妥善解决。

5. 特殊情况考虑

若爷爷因年事已高、精神状况不佳等原因无法配合过户，可考虑通过法定程序指定监护人，由监护人代为办理过户手续。但此举需严格遵循法律规定，确保监护人的指定合法有效。

总结：针对您提出的问题，建议首先尝试与爷爷进行沟通协商，了解其真实想法和顾虑；若沟通无果，可考虑通过法律途径解决过户问题。在处理过程中，应尊重法律程序、保持理性沟通，并在必要时寻求专业帮助。