针对您提出的“分项工序质量不合格监理单位通过了验收如何处罚”的问题，根据《建设工程质量管理条例》的相关规定，我们可以进行如下详细解答：

首先，需要明确的是，如果工程监理单位将不合格的分项工序、建筑材料、构配件或设备按照合格签字通过验收，这属于违法行为，将受到相应的行政处罚。

具体处罚标准依据违法行为的严重程度来划分：

1. 轻微违法行为：

   • 表现情形：未造成工程质量事故。
   • 处罚标准：责令改正，并处以50万元以上60万元以下的罚款。同时，可能会降低监理单位的资质等级或者吊销其资质证书。如果有违法所得，还将予以没收。

2. 一般违法行为：

   • 表现情形：造成工程质量事故，但情节尚不严重。
   • 处罚标准：责令改正，并处以60万元以上80万元以下的罚款。同样，可能会降低监理单位的资质等级或者吊销其资质证书，并没收违法所得。

3. 严重违法行为：

   • 表现情形：造成严重工程质量事故。
   • 处罚标准：责令改正，并处以80万元以上100万元以下的罚款。在此情况下，监理单位的资质等级很可能会被降低或者其资质证书被吊销，同时违法所得也将被没收。

此外，如果监理单位的违法行为造成了损失，它还需要承担连带赔偿责任。

综上所述，工程监理单位在验收过程中如果将不合格的分项工序等按照合格签字通过，将面临严厉的行政处罚，包括罚款、降低资质等级或吊销资质证书，以及没收违法所得和承担连带赔偿责任。这些处罚措施旨在维护工程质量的严肃性，保障公众利益和安全。因此，监理单位应严格遵守相关法规，确保验收工作的公正性和准确性。