已取得土地经营权证书，在一般情况下不算权属不清。以下是对此问题的详细分析：

一、土地经营权证书的法律效力

土地经营权证书是确认土地经营权归属的法定凭证。根据相关法律法规，土地经营权证书的颁发意味着土地经营权的权属已经得到了法律的确认和保护。因此，在正常情况下，持有土地经营权证书的主体，其土地经营权的权属是清晰的。

二、权属不清的可能情形

尽管土地经营权证书是确认权属的重要凭证，但在某些特殊情况下，仍可能出现权属不清的问题。这些情形包括但不限于：

1. 证书颁发错误：由于行政机关的疏忽或错误，可能导致土地经营权证书的颁发对象与实际权利人不符。这种情况下，虽然持有证书，但权属实际上并不清晰。

2. 权属争议：在土地经营权证书颁发后，如果其他主体对土地经营权提出异议，并引发权属争议，那么在争议解决前，土地经营权的权属可以视为不清。

3. 证书遗失或损毁：如果土地经营权证书遗失或损毁，且未及时补办或重新确认权属，那么在补办或重新确认前，土地经营权的权属也可能被视为不清。不过，这种情况更多是程序上的问题，而非实质上的权属不清。

三、法律建议

1. 妥善保管证书：作为土地经营权的法定凭证，土地经营权证书应妥善保管，避免遗失或损毁。

2. 及时处理权属争议：如果发生权属争议，应及时通过法律途径解决，以维护自己的合法权益。

3. 关注证书有效性：定期关注土地经营权证书的有效性，确保其未过期或被撤销。如果发现证书存在问题，应及时向相关部门申请更正或补办。

如果您在土地经营权方面遇到任何问题或疑虑，可以直接向我咨询。我会根据您的具体情况，提供专业的法律建议和帮助。