药品经营企业未在职在岗履职，可能会面临多种处罚，具体取决于未履职的具体情况、相关法律法规的规定以及监管部门的判断。以下从不同角度进行分析：
一、行政处罚角度
警告与责令改正：
- 如果药品经营企业的相关人员（如质量管理人员、执业药师等）未在职在岗履职，但情节较轻，未造成严重后果，监管部门可能会首先给予警告，并责令企业限期改正。
罚款：
- 根据《中华人民共和国药品管理法》及相关规定，如果药品经营企业未按照规定配备相关人员，或者相关人员未在职在岗履职，且情节严重，监管部门有权对企业处以罚款。罚款的数额会根据违法行为的情节、性质、后果等因素综合确定。
- 例如，若企业未按规定配备执业药师，或者执业药师不在岗时销售处方药，可能会面临数千至数万元不等的罚款。
吊销许可证：
- 在极端情况下，如果药品经营企业的违法行为特别严重，如多次未改正、造成严重后果等，监管部门可能会吊销企业的药品经营许可证，从而禁止其继续从事药品经营活动。
二、刑事责任角度
- 虽然药品经营企业未在职在岗履职本身不直接构成刑事犯罪，但如果该行为导致了严重后果，如假药劣药流入市场、造成患者伤亡等，相关责任人员可能会因涉嫌生产、销售假药罪或生产、销售劣药罪等而被追究刑事责任。
三、实际操作与建议
加强内部管理：
- 药品经营企业应建立健全内部管理制度，确保相关人员（如质量管理人员、执业药师等）在职在岗履职，并定期进行自查自纠。
及时整改与报告：
- 如果发现相关人员未在职在岗履职，企业应立即进行整改，并向监管部门报告整改情况。这有助于减轻可能的行政处罚。
寻求法律帮助：
- 如果企业面临监管部门的调查或处罚，应及时寻求专业律师的法律帮助，以了解自身权利义务，并制定合适的应对策略。
举例说明：
- 假设某药品经营企业因执业药师未在职在岗而被监管部门查处。如果该行为情节较轻，且企业及时整改并报告了整改情况，监管部门可能会给予警告并责令改正。但如果该行为情节严重，如多次发生且未整改，或者导致了假药劣药流入市场等严重后果，企业可能会面临罚款甚至吊销许可证的处罚。
特别提醒：药品经营企业的合规经营至关重要，不仅关系到企业的生存和发展，更关系到广大患者的用药安全和健康。因此，企业应严格遵守相关法律法规和规定，确保相关人员在职在岗履职。如果有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。