在股权转让公示期遇到异议时，您可以按照以下步骤来处理：
一、及时沟通，明确异议内容
首先，您应当与提出异议的相关方进行及时、坦诚的沟通。通过沟通，明确异议的具体内容和原因，这有助于您更准确地理解对方的立场和关切点，从而避免误解进一步加深。
二、尝试协商解决分歧
在明确异议内容后，您可以尝试与对方进行协商，寻求双方都能接受的解决方案。协商过程中，要保持开放和包容的态度，尊重对方的意见和需求，努力达成共识。如果能够通过协商解决分歧，那么这将是最为高效和和谐的方式。
三、依据协议启动仲裁或诉讼程序
如果沟通协商无法达成一致，您可以依据股权转让协议中的约定条款，启动仲裁或诉讼程序。在启动这些程序之前，请确保您已经充分了解了协议中的相关条款，并准备好了相应的证据来支持自己的主张。
仲裁程序：如果协议中约定了仲裁条款，您可以向约定的仲裁机构提交仲裁申请。仲裁机构将根据双方的证据和陈述，作出具有法律约束力的裁决。
诉讼程序：如果协议中没有约定仲裁条款，或者您选择不通过仲裁解决争议，您可以向有管辖权的人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，您需要提交起诉状和相关证据，法院将依法进行审理并作出判决。
四、遵守法律法规和司法程序
在处理股权转让异议的过程中，无论您选择协商、仲裁还是诉讼，都必须严格遵守相关的法律法规和司法程序。这包括但不限于提交证据的期限、出庭的时间、遵守法庭纪律等。确保处理过程的合法性和公正性，是维护您自身权益的重要保障。
五、寻求专业法律帮助
如果您在处理股权转让异议的过程中遇到困难或不确定如何操作，建议您寻求专业的法律帮助。律师可以为您提供法律咨询、代理诉讼或仲裁等服务，帮助您更好地维护自己的权益。
总之，在股权转让公示期遇到异议时，您应当保持冷静和理性，通过及时沟通、协商解决、依据协议启动仲裁或诉讼程序等方式来处理。同时，要遵守相关法律法规和司法程序的规定，确保处理过程的合法性和公正性。