分期建设的工程开工时间计算需结合合同约定与法律规定，具体分以下情形处理：

1. 合同明确约定分期开工时间的
   若建设工程施工合同中已明确约定各期工程的开工时间（如“一期工程于2024年3月1日开工，二期工程于2025年6月1日开工”），则以合同约定为准。此时需注意：

   • 合同条款需符合《民法典》第143条规定的民事法律行为有效要件（行为人具有相应能力、意思表示真实、不违法违规）；
     
   • 若因发包人原因导致实际开工时间晚于约定时间，承包人可依据《民法典》第577条主张违约责任（如赔偿损失、顺延工期）。

2. 合同未约定但已办理施工许可证的
   根据《建筑工程施工许可管理办法》第8条，建设单位应当自领取施工许可证之日起3个月内开工。因故不能按期开工的，需在期满前向发证机关申请延期（每次延期不超过3个月，最多延期两次）。此时：

   • 首期工程开工时间：以施工许可证载明的开工日期或实际开工日期（以监理单位签发的开工令为准）为准；
     
   • 后续分期工程开工时间：若后续工程需重新办理施工许可，则以新许可证载明日期为准；若无需重新办理，则以发包人签发的分期开工通知为准。

3. 合同未约定且未办理施工许可证的
   若工程未取得施工许可证即开工，属于违法建设行为。此时：

   • 行政责任：根据《建筑法》第64条，建设单位可能被责令停止施工、限期改正，处工程合同价款1%-2%的罚款；
     
   • 民事责任：若因未办证导致工期延误，法院可能结合实际履行情况（如是否具备开工条件、双方过错程度）认定开工时间。例如，若承包人已实际进场施工且发包人未提出异议，可能以实际进场日作为开工时间。

4. 因发包人原因导致开工条件不具备的
   若因发包人未完成“三通一平”（通水、通电、通路、场地平整）、未提供设计图纸等导致无法开工，承包人可依据《民法典》第803条（发包人未按照约定提供条件，承包人有权顺延工期并请求赔偿）主张权利。此时：

   • 开工时间以“障碍消除日”为准（如发包人完成场地平整的日期）；
     
   • 若合同约定了“开工准备期”，则以准备期届满日作为开工时间。

实务建议：

• 签订合同时应明确分期工程的开工时间、条件及违约责任；
  
• 开工前务必取得施工许可证，避免行政处罚风险；
  
• 保留开工通知、监理日志、进场记录等证据，以备纠纷时举证。
  

如有具体案件或合同条款需要分析，可直接向我提供细节进一步咨询。