赔偿金签协议与赔偿并不必然同步，具体是否同步取决于双方在协议中的约定。以下从不同角度为您详细分析：
一、协议约定优先
在签订楼上漏水赔偿协议时，双方可以就赔偿金的支付时间、方式等具体条款进行协商并明确写入协议。如果协议中明确规定了赔偿金与协议签订同步支付，或者规定了具体的支付时间节点（如协议签订后X日内支付），那么双方就应当按照协议约定来履行。这种情况下，赔偿金的支付与协议签订是同步或者按照约定时间进行的。
二、无约定时的处理
如果协议中没有明确规定赔偿金的支付时间，那么根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，履行期限不明确的，债务人可以随时履行，债权人也可以随时请求履行，但是应当给对方必要的准备时间。在楼上漏水赔偿的情境中，这意味着如果协议没有规定具体的支付时间，受损方（债权人）可以随时要求楼上住户（债务人）支付赔偿金，但应当给予对方合理的准备时间。不过，在实际操作中，为了避免纠纷和确保权益，建议双方在协议中尽可能明确赔偿金的支付时间和方式。
三、实际操作中的建议
明确协议条款：在签订赔偿协议时，双方应当就赔偿金的金额、支付时间、支付方式等关键条款进行明确约定，以避免后续纠纷。
保留证据：无论是协议签订过程还是赔偿金支付过程，双方都应当保留好相关证据，如协议文本、支付凭证等，以备不时之需。
及时沟通：如果在协议履行过程中出现任何问题或争议，双方应当及时沟通并寻求解决方案，以避免问题扩大化。
举例说明：假设楼上住户因漏水导致您家受损，双方经过协商签订了一份赔偿协议。协议中明确规定，楼上住户应在协议签订后5日内向您支付赔偿金5000元。那么，在这种情况下，赔偿金的支付就是与协议签订同步进行的（按照约定时间）。如果协议中没有规定具体的支付时间，那么您可以在协议签订后随时要求楼上住户支付赔偿金，但应当给予对方合理的准备时间。
最后，如果您在楼上漏水赔偿协议签订或履行过程中遇到任何法律问题或困惑，可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律建议和帮助。