银行直接冻结银行卡，在特定情况下是合法的。具体分析如下：
银行系统冻结：
- 银行在特定情况下，如检测到银行卡存在异常交易、频繁操作、误操作输入错误密码等，为了保护持卡人的资金安全，会采取临时性冻结措施。
- 这种冻结是银行系统自动监测并实施的，可能不会实时通知持卡人，但通常会通过短信或系统消息提醒。
- 法律依据：此情况基于银行的风险控制策略和操作规定，虽无直接法律依据，但属于银行正常的管理措施。
司法机关冻结：
- 在涉及法律案件，如信用卡欠款、贷款不还、洗钱等违法行为时，银行根据司法机关的申请，有权冻结相关银行卡。
- 这种冻结是司法机关为了案件侦查、起诉、审判等需要而采取的强制措施，银行必须配合执行。
- 法律依据：《中华人民共和国民事诉讼法》等相关法律规定，司法机关在特定情况下有权对当事人的财产采取查封、扣押、冻结等措施。
其他合法冻结情况：
- 如银行卡过期未重新申请新卡，银行有权在到期后冻结过期的银行卡。
- 如持卡人涉及其他违法行为或合同违约，且相关合同或法律条款明确规定了冻结措施，银行也有权依据合同或法律直接冻结银行卡。
综上所述，银行直接冻结银行卡在特定情况下是合法的，既可能是银行基于风险控制的管理措施，也可能是司法机关为了案件处理需要而采取的强制措施。持卡人在遇到银行卡被冻结的情况时，应先查明冻结原因，然后根据具体情况采取相应的解冻措施或寻求法律帮助。如有进一步需要，您可以继续咨询我。