结论前置：关于“协议和国企签过交保证金到别的公司是否合法”的问题，这并非一个简单的合法或非法可以判断的，需要结合具体情况来分析。

1. 协议内容与目的：

• 首先，要审查与国企签订的协议内容。如果协议中明确规定了保证金的支付对象、金额、用途以及支付条件等，并且这些条款均符合法律法规的规定，那么将保证金支付到协议指定的公司（即便是非国企）可能是合法的。
• 然而，如果协议内容模糊，或者保证金支付对象与协议目的不符，甚至存在利用国企名义进行非法集资、洗钱等违法行为，那么这种支付行为显然是非法的。

2. 保证金支付流程的合规性：

• 保证金支付应当遵循严格的财务和审计流程。如果支付流程符合公司内部规定以及相关法律法规的要求，比如有合法的支付凭证、审批手续等，那么支付行为可能是合法的。
• 反之，如果支付流程存在漏洞，比如未经审批擅自支付、支付凭证不合法等，那么这种支付行为可能构成违规，甚至违法。

3. 接收保证金公司的资质与信誉：

• 接收保证金的公司应当具备合法的经营资质和良好的信誉。如果该公司是合法注册、经营规范的企业，且没有不良记录，那么将保证金支付到该公司可能是安全的。
• 但是，如果接收保证金的公司存在违法经营、欺诈等行为，或者其资质存疑，那么将保证金支付到该公司可能面临法律风险。

4. 法律法规的遵循：

• 在任何情况下，保证金的支付都必须严格遵守国家法律法规的规定。比如，不得违反反洗钱法、反不正当竞争法等相关法律法规。
• 如果支付行为违反了法律法规的规定，那么无论协议内容如何、支付流程如何合规、接收公司资质如何，这种支付行为都是非法的。

法律建议：

• 在与国企签订协议并涉及保证金支付时，务必仔细审查协议内容，确保所有条款均合法合规。
• 严格按照公司内部规定和相关法律法规的要求进行保证金支付，确保支付流程的合规性。
• 对接收保证金的公司进行充分的尽职调查，确保其具备合法的经营资质和良好的信誉。
• 如果在保证金支付过程中遇到任何疑问或问题，建议及时咨询专业律师以获取法律意见。

可能的法律后果：

• 如果保证金支付行为被认定为非法，可能面临法律制裁，包括但不限于罚款、没收违法所得、甚至刑事责任等。
• 此外，非法支付行为还可能对公司的声誉和信誉造成严重影响，进而影响公司的正常经营和发展。

因此，在涉及与国企签订协议并支付保证金到别的公司时，务必谨慎行事，确保所有行为均合法合规。如果有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。