报废车拆解厂若其厂房下的井存在超标排放等违法行为，将由生态环境主管部门责令限期改正，并依法予以处罚；拒不改正或逾期未改正的，原发证部门将撤销其《资质认定书》。具体分析如下：

一. 违法行为的认定

在报废车拆解过程中，若厂房下的井（如窨井）被用于排放废水且排放物超标，如石油类浓度超出排放标准，则构成违法行为。这一行为违反了《中华人民共和国水污染防治法》的相关规定。

二. 处罚措施

1. 责令限期改正

   • 根据相关法律法规，生态环境主管部门将首先责令报废车拆解厂限期改正其违法行为，即确保废水排放符合国家标准。

2. 依法予以处罚

   • 若报废车拆解厂未能在规定期限内改正违法行为，生态环境主管部门将依法对其处以罚款等行政处罚。具体罚款数额将根据违法行为的严重程度、造成的环境损害等因素综合确定。

3. 撤销《资质认定书》

   • 若报废车拆解厂拒不改正或逾期未改正其违法行为，且情节严重，原发证部门（如商务主管部门）将撤销其《报废机动车回收拆解资质认定书》。这意味着该拆解厂将失去从事报废机动车回收拆解活动的资格。

三. 法律依据

• 《中华人民共和国水污染防治法》第十条：排放水污染物，不得超过国家或者地方规定的水污染物排放标准和重点水污染物排放总量控制指标。
• 《中华人民共和国水污染防治法》第八十三条第二项：违反本法规定，有下列行为之一的，由县级以上人民政府环境保护主管部门责令改正或者责令限制生产、停产整治，并处十万元以上一百万元以下的罚款；情节严重的，报经有批准权的人民政府批准，责令停业、关闭：（二）超过水污染物排放标准或者超过重点水污染物排放总量控制指标排放水污染物的。

四. 生活实例

• 例如，某报废车拆解厂在拆解过程中，将含有超标石油类物质的废水直接排入厂房下的窨井，导致周边环境受到污染。生态环境主管部门在接到举报后，对该拆解厂进行了调查取证，并依据相关法律法规责令其限期改正违法行为，并处以相应罚款。若该拆解厂未能按期改正，其《报废机动车回收拆解资质认定书》将被撤销。

我建议报废车拆解厂应严格遵守相关法律法规，确保废水排放符合国家标准，避免造成环境污染和面临法律处罚。同时，相关部门也应加强监管力度，对违法行为进行严厉打击。如有进一步需要，您可以继续咨询我。