员工辞职时，公司应支付的补偿项目主要包括经济补偿金、代通知金（如适用）、医疗补助费（如适用）以及其他可能的补偿（如未休年假补偿、加班费结算等）。以下是详细分析：
一. 经济补偿金
定义与适用情形：经济补偿金是用人单位在与劳动者解除劳动合同时，依法一次性支付给劳动者的经济补助。在员工辞职的情况下，如果辞职是因为用人单位存在过错（如未提供劳动保护、未及时足额支付劳动报酬等），或者双方协商一致解除劳动合同，且由用人单位提出，那么员工有权获得经济补偿金。
计算标准：根据《劳动合同法》第四十七条，经济补偿金按劳动者在本单位工作的年限计算，每满一年支付一个月工资的标准支付；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。月工资指劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。
二. 代通知金
定义与适用情形：代通知金是用人单位在未提前三十日以书面形式通知劳动者本人解除劳动合同的情况下，额外支付的一个月工资。在员工辞职的情境中，这一补偿项目通常不适用，因为代通知金是针对用人单位未提前通知解除劳动合同的补偿，而员工辞职是员工主动提出解除劳动合同。
计算标准：若特殊情况下适用，代通知金按照该劳动者上一个月的工资标准确定。
三. 医疗补助费
定义与适用情形：对于因病或非因工负伤被鉴定为部分丧失劳动能力的员工，在解除劳动合同时，用人单位除支付经济补偿金外，还需支付医疗补助费。这一补偿项目在员工辞职时也可能适用，但前提是员工因病或非因工负伤，且被鉴定为部分丧失劳动能力。
支付标准：医疗补助费的具体数额和支付方式可能因地区和具体政策而异，需参照当地相关规定执行。
四. 其他可能的补偿
未休年假补偿：如果员工在辞职前还有未休的年假，公司应按照相关规定支付未休年假的补偿。
加班费结算：如果员工在辞职前存在加班未结算的情况，公司应支付相应的加班费。
综上所述，员工辞职时公司应支付的补偿项目主要包括经济补偿金（如适用）、医疗补助费（如适用）以及其他可能的补偿（如未休年假补偿、加班费结算等）。具体支付哪些补偿项目以及补偿的具体数额，需要根据员工的辞职原因、工作年限、工资水平以及当地的相关法律法规来确定。