针对您提出的“员工交新农合不交社保是否合法”的问题，我们可以从法律层面进行详细解答。
首先，需要明确的是，依法参加社会保险是用人单位和劳动者的法定义务。根据《中华人民共和国社会保险法》以及最高人民法院发布的《最高人民法院关于审理劳动争议案件适用法律问题的解释(二)》的相关规定，用人单位必须为劳动者缴纳社会保险费，这包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险等。这一义务不因双方约定或劳动者单方承诺而免除。
对于您提到的“员工交新农合不交社保”的情况，我们需要明确以下几点：
新农合与社保的区别：新农合（新型农村合作医疗）主要是针对农村居民的医疗保险制度，而社保则是更广泛的社会保障体系，涵盖了养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险等多个方面。对于在职员工来说，社保是强制性的，而新农合则不是其替代品。
不交社保的违法性：如果用人单位与员工约定或员工单方承诺不交社保，而只交新农合，这种约定或承诺是无效的。因为社保是法定义务，不因双方约定而免除。用人单位未依法缴纳社会保险费的，劳动者有权根据劳动合同法相关规定请求解除劳动合同，并由用人单位支付经济补偿。
法律后果：如果用人单位未依法为劳动者缴纳社会保险费，劳动者不仅可以解除劳动合同并要求经济补偿，还可以依法请求社会保险费征收机构责令用人单位限期缴纳或者补足。此外，如果用人单位已经将社会保险费以补助等形式发放给劳动者，并在行政机关责令补缴后要求劳动者返还的，人民法院也会依法予以支持。
综上所述，员工交新农合而不交社保是不合法的。用人单位必须依法为劳动者缴纳社会保险费，这是其法定义务，不因双方约定或劳动者单方承诺而免除。如果用人单位未履行这一义务，劳动者有权依法维护自己的权益。