工资由劳务派遣公司发放，主要是因为劳务派遣这种用工形式的特殊性。下面我将从劳务派遣的定义、工资发放的逻辑、劳务派遣公司的义务以及员工权益保障等角度，为你详细解释。

一、劳务派遣的定义与关系

劳务派遣是指劳务派遣机构与派遣劳工订立劳动合同，将劳动者派往其他用工单位工作，并由用工单位向派遣机构支付服务费用的一种用工方式。在这种模式下，劳动者与劳务公司建立劳动关系，而被派遣至实际用工单位提供劳务。因此，从法律关系上讲，劳务派遣公司是劳动者的用人单位，承担着支付工资等法定义务。

二、工资发放的逻辑

1. 用工单位支付费用：用工单位根据劳务派遣协议，将劳动者的工资、社保费用及服务费支付给劳务公司。
2. 劳务公司发放工资：劳务公司在扣除管理费用后，按照与劳动者的约定发放工资。这一过程中，劳务公司作为用人单位，必须确保工资的按时足额发放。

三、劳务派遣公司的义务

作为法律上的用人单位，劳务派遣公司需履行多项义务，其中与工资发放相关的包括：

1. 按时足额支付劳动报酬：劳务派遣公司应按照劳动合同的约定，按时、足额地向劳动者发放工资，且支付的工资不得低于当地最低工资标准。
2. 提供工资清单：劳务派遣公司有义务向劳动者提供相应的工资清单，以便劳动者核对工资明细。
3. 无工作期间的报酬支付：在被派遣劳动者无工作期间，劳务派遣公司应按所在地政府规定的最低工资标准支付报酬。

四、员工权益保障

1. 了解详情：作为劳动者，你有权了解工资由劳务公司发放的具体原因和细节。这有助于你明确自己的雇佣状态和权益，避免因信息不对称而遭受损失。
2. 维权途径：若你的工资被拖欠或克扣，你可以依据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，向劳动行政部门投诉或申请劳动仲裁。在维权过程中，你可以提供劳动合同、工资清单等证据来支持自己的主张。

五、特殊情况说明

虽然原则上工资由劳务派遣公司发放，但在实际操作中，也可能存在用工单位直接代发工资的情况。这种操作方式在一定程度上方便了用工单位和劳动者，但需要注意的是，这仅仅是一种变通操作，并不改变劳务派遣公司作为工资支付主体责任方的法律地位。劳务派遣公司不能因为委托用工单位代发工资而免除自身在工资支付方面的法定责任。

总结与建议：

工资由劳务派遣公司发放是劳务派遣这种特殊用工形式下的常见做法。作为劳动者，你应了解自己的雇佣状态和权益，并在必要时采取合适的维权措施来保护自己的合法权益。如果你对工资发放或其他劳动权益方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。