股权转让协议中仲裁委的选择主要取决于协议双方的约定。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：

1. 协议约定优先

在股权转让协议中，双方可以明确约定争议解决的方式和机构。如果协议中明确指定了某个仲裁委员会作为争议解决的机构，那么双方就应当按照协议的约定，向该仲裁委员会申请仲裁。例如，在哈尔滨仲裁委员会成功化解的涉外股权争议案例中，双方就在《股权转让协议》中明确约定了“若就协议发生一切争议，提交哈尔滨仲裁委员会解决”。

2. 无约定时的处理

如果股权转让协议中没有明确约定仲裁委员会，或者约定的仲裁委员会不存在、不明确，那么根据《中华人民共和国仲裁法》的相关规定，双方可以协商选择一个仲裁委员会进行仲裁。如果协商不成，或者一方拒绝协商，那么另一方可以根据实际情况，选择一个有管辖权的仲裁委员会提起仲裁申请。但需要注意的是，在没有明确约定的情况下，不能随意选择一个仲裁委员会进行仲裁，否则可能会因管辖权问题而导致仲裁裁决被撤销或不予执行。

3. 仲裁委员会的选择原则

在选择仲裁委员会时，双方可以考虑以下因素：

• 专业性：选择具有处理股权转让纠纷专业能力和经验的仲裁委员会。
• 公正性：选择公正、中立的仲裁委员会，以确保仲裁裁决的公正性和权威性。
• 效率性：考虑仲裁委员会的办案效率和周期，选择能够快速解决纠纷的仲裁委员会。
• 地域性：如果纠纷涉及地域因素，可以考虑选择与纠纷发生地或协议签订地有关的仲裁委员会。

4. 实际操作建议

• 明确约定：在签订股权转让协议时，双方应当明确约定争议解决的方式和机构，以避免后续纠纷。
• 了解仲裁规则：在选择仲裁委员会前，双方应当了解该仲裁委员会的仲裁规则、办案流程等，以确保仲裁的顺利进行。
• 咨询专业律师：如果双方对仲裁委员会的选择有疑问或争议，可以咨询专业律师的意见，以获取更准确的法律建议。

举例说明：假设A公司和B公司签订了一份股权转让协议，协议中明确约定了“若就协议发生一切争议，提交北京仲裁委员会解决”。那么，在后续发生纠纷时，双方就应当按照协议的约定，向北京仲裁委员会申请仲裁。如果协议中没有明确约定仲裁委员会，双方可以协商选择一个仲裁委员会进行仲裁，如中国国际经济贸易仲裁委员会等。

最后需要强调的是，股权转让协议中的仲裁条款是双方解决争议的重要依据，双方应当认真对待并明确约定。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。