您好，关于职工强占单位房屋的问题，单位确实有权采取一系列措施来维护自身的合法权益。以下是一些详细且有针对性的建议：

首先，单位应当尝试与强占者进行沟通协商。在这一过程中，应明确告知强占者其行为的违法性以及可能产生的后果，并要求其限期搬离。这是一种相对温和且成本较低的处理方式，有助于维护单位与职工之间的和谐关系。

如果沟通协商无果，单位有权采取法律手段来维护自身权益。具体来说，单位可以向公安机关报案。强占单位房屋的行为可能涉嫌非法侵入住宅等违法犯罪行为，公安机关会依法进行调查处理，并根据具体情况采取相应的措施，如责令强占者停止侵害、恢复原状等。

此外，单位还可以通过民事诉讼途径来解决问题。单位可以向法院提起诉讼，要求强占者腾退房屋，并赔偿因强占行为给单位造成的损失，如租金损失等。在诉讼过程中，单位需要提供充分的证据来支持其主张，包括房屋产权证明、强占者强占房屋的现场照片、视频资料、证人证言等。法院会依据事实和法律作出公正判决。

如果判决生效后强占者仍不履行，单位可以向法院申请强制执行。强制执行是法律赋予单位的一项重要权利，可以确保判决得到切实履行。

综上所述，单位在面对职工强占房屋的情况时，应通过合法、有效的途径妥善处理。在整个过程中，单位应注意及时收集和固定相关证据，以便在处理过程中能够有力支持自身主张，维护合法权益。同时，单位也应保持冷静和理性，避免采取过激行为导致矛盾升级。