关于村集体土地流转用于村上还债是否合法的问题，这需要根据具体的法律规定和实际情况来判断。以下是对此问题的详细分析：
首先，我们要明确土地流转的基本原则和法律规定。土地流转必须遵循相关法律法规及政策规定，确保流转程序合法合规。这通常要求签订规范的流转合同，明确双方的权利义务，包括流转方式、期限、价款及支付方式等内容。同时，流转用途必须符合规定，不得擅自改变土地的农业用途，严禁用于非农建设。在保障农民权益方面，应尊重农民意愿，确保农民在流转过程中得到合理补偿，不损害其长远利益。
针对村集体土地流转用于村上还债的情况，我们需要考虑以下几个方面：
流转程序是否合法：村集体土地流转必须按照法定程序进行，通常需要经过村民会议或村民代表的同意，并签订规范的流转合同。如果流转程序存在瑕疵，如未经村民同意或合同不规范等，那么该流转行为可能不合法。
流转用途是否符合规定：土地流转的用途必须符合相关法律法规及政策规定。如果村集体将土地流转用于非农业用途，如还债等，且该用途未经相关部门批准或不符合土地利用总体规划，那么该流转行为可能不合法。
是否损害农民权益：在土地流转过程中，必须保障农民的合法权益。如果村集体以还债为由，强迫农民流转土地或给予不合理的补偿，那么该流转行为可能不合法。
综上所述，村集体土地流转用于村上还债的合法性取决于具体的流转程序、用途以及是否损害农民权益。如果流转行为符合相关法律法规及政策规定，且经过合法的程序并给予了农民合理的补偿，那么该流转行为可能是合法的。然而，如果流转行为存在违法情形或损害了农民的权益，那么该流转行为则不合法。
因此，在进行村集体土地流转时，建议咨询专业的法律人士或相关部门，确保流转行为的合法性和合规性。