在分居两年后起诉离婚，若被告不到庭，法院会依据相关法律法规和原告提供的证据进行审理并作出判决。以下是对这一问题的详细解答：

一、被告不到庭，法院如何处理？

1. 缺席判决的可能性：

   • 离婚诉讼涉及身份关系，被告原则上应出庭。若被告经传票传唤，无正当理由拒不到庭，法院有权进行缺席判决。
   • 缺席判决并不意味着法院会轻易判离，法院仍会依据原告提供的证据，审查夫妻感情是否确已破裂。

2. 被告有正当理由不到庭：

   • 若被告因重病、不可抗力等正当理由无法出庭，可向法院提交书面申请并说明理由。
   • 法院会根据情况决定是否延期审理，以确保被告的合法权益得到保障。

二、原告需提供哪些证据？

1. 分居证据：

   • 原告需证明因感情不和分居已满两年，如提供分居协议、租房合同、居委会证明、证人证言等。
   • 这些证据应能清晰反映分居的时间、原因及双方的生活状态。

2. 感情破裂证据：

   • 除了分居证据外，原告还需提供其他能证明夫妻感情确已破裂的证据，如通信记录、聊天记录、照片等。
   • 这些证据应能体现双方在分居期间或之前的矛盾、冲突及无法调和的情况。

三、法院如何判决？

1. 判决准予离婚的情形：

   • 若原告能提供充分证据证明因感情不和分居已满两年，且符合《民法典》规定的其他准予离婚情形（如感情确已破裂等），法院可能会判决准予离婚。
   • 分居两年是判断感情破裂的重要参考因素之一，但并非唯一标准。

2. 判决不准予离婚的情形：

   • 若原告无法提供有效证据证明分居两年或感情破裂，即使被告不出庭，法院为谨慎处理婚姻关系，避免草率判离，也可能不会判决离婚。
   • 法院会综合考虑双方的感情基础、婚姻状况、子女利益等因素，作出最合理的判决。

四、被告不到庭的后续影响

1. 财产分割：

   • 若被告缺席，法院会依据原告主张及证据来分割夫妻共同财产。
   • 缺席方可能因无法充分主张与保障自己的财产权益而遭受损失。

2. 子女抚养：

   • 缺席方无法表达自身对抚养权及探视权的想法，法院会基于最有利于子女成长的原则进行判决。
   • 缺席方可能失去抚养权，且后续行使探视权也可能受限。

3. 判决执行：

   • 判决生效后，若缺席方不履行判决义务（如支付抚养费、配合房产过户等），胜诉方可申请强制执行。
   • 缺席方可能面临财产被查封、扣押等强制执行措施。

五、建议

• 原告：应尽力收集并提供充足的证据，以支撑自己的请求。同时，考虑与被告进行沟通，尝试通过调解解决纠纷。
• 被告：若因特殊原因无法出庭，应及时向法院提交书面申请并说明理由。若可能，尽量出庭参与诉讼，以维护自己的合法权益。

总之，在分居两年后起诉离婚，若被告不到庭，法院会依据法律规定和证据进行审理并作出判决。原告应充分准备证据，被告也应积极应对诉讼，以确保双方的合法权益得到保障。