结论前置：商品交易涉嫌犯罪时，是否开具发票需结合具体犯罪类型、交易性质及法律义务综合判断，但开具发票本身不改变交易涉嫌犯罪的法律定性，且可能因涉及虚开发票等行为进一步加重法律责任。以下分情况说明：
1. 交易本身构成犯罪（如销售伪劣产品、走私等）
- 法律义务：根据《发票管理办法》，销售方在交易完成后仍有义务按实际交易金额开具发票，这是行政法上的义务，与交易是否合法无关。
- 刑事风险：若交易本身构成犯罪（如销售假冒注册商标的商品），开具发票可能成为证明犯罪金额的证据，但不因开具发票而免除刑事责任。例如，销售假酒构成销售伪劣产品罪，发票记录的销售金额可能被认定为犯罪数额。
- 例外情形：若交易被认定为“非法交易”（如走私、贩毒），因交易本身不受法律保护，开具发票可能因缺乏合法基础而无效，但实践中仍可能因涉及虚开发票（如为掩盖非法交易而伪造发票）被追究刑事责任。
2. 交易过程中涉及虚开发票犯罪
- 虚开发票罪的构成：根据《刑法》第205条，为他人、为自己开具与实际经营业务情况不符的发票，或让他人为自己开具、介绍他人开具此类发票，均可能构成虚开发票罪。
- 典型场景：
- 交易本身合法，但为偷逃税款而虚开发票（如多开金额、虚构交易）；
- 交易涉嫌犯罪（如诈骗），同时通过虚开发票掩盖资金流向。
- 法律后果：虚开发票罪与交易涉嫌的犯罪可能数罪并罚。例如，诈骗罪与虚开发票罪并罚时，刑罚将更重。
3. 交易合法但后续被牵连涉嫌犯罪
- 善意取得发票的抗辩：若交易本身合法，但因上游供应商涉嫌犯罪（如虚开发票）导致自身被牵连，可主张“善意取得”发票进行抗辩，但需证明自身对上游犯罪不知情且无过错。
- 举证责任：需提供合同、付款凭证、物流单据等证据，证明交易真实性及自身无主观故意。
实务建议
- 交易合法性优先：无论是否开具发票，交易本身若涉嫌犯罪（如销售违禁品），刑事责任无法通过发票行为免除。
- 避免虚开发票：即使交易合法，也需确保发票内容与实际业务一致，防止因虚开发票被追究刑事责任。
- 证据留存：交易过程中应保留合同、付款记录、物流单据等，以证明交易真实性，降低被牵连风险。
总结：商品交易涉嫌犯罪时，开具发票是行政法义务，但需避免虚开发票行为；交易本身的合法性是刑事责任的核心判断标准，发票行为可能作为证据或加重情节，但无法改变定性。如有具体案件，可直接向我咨询细节。