目击证人在理论上具有不配合公安机关调查的权利，但在特定情形下，如刑事诉讼中经法院通知无正当理由拒不出庭作证，可能会面临法律后果。以下是对此问题的详细分析：

1. 理论上的不配合权利：

   • 在我国，虽然法律明确规定了知晓案件情况的单位和个人有作证的义务，但并未赋予司法机关强制证人作证的权力。因此，从理论上讲，目击证人具有不配合公安机关调查的权利。这种权利体现了对个人自由和隐私的尊重，也是法律赋予公民的一种基本权利。

2. 刑事诉讼中的特殊情形：

   • 然而，在刑事诉讼中，情况会有所不同。如果目击证人被法院通知出庭作证，且无正当理由拒不出庭，法院有权强制其到庭。这是为了确保刑事诉讼的顺利进行，保障被告人的合法权益，以及维护司法公正。
   • 进一步地，如果目击证人无正当理由拒不出庭或者出庭后拒绝作证，法院可以对其予以训诫。情节严重的，经院长批准，还可以处以十日以下的拘留。这种处罚措施旨在维护司法秩序，确保证人能够履行其作证义务。

3. 作证义务与法律责任：

   • 目击证人作为知晓案件情况的人，有义务向司法机关提供真实、准确的证言。这是法律对证人的一种基本要求，也是维护司法公正的重要保障。
   • 如果目击证人故意作伪证或者隐匿罪证，将需要承担相应的法律责任。这种责任可能包括刑事处罚和民事赔偿等，具体取决于伪证或隐匿罪证的情节和后果。

4. 实际操作中的建议：

   • 对于目击证人而言，虽然理论上具有不配合的权利，但在实际操作中，建议还是尽量配合司法机关的调查工作。这不仅是履行法律义务的表现，也是维护社会公正和法治秩序的重要一环。
   • 如果目击证人确实存在无法配合的情况（如健康原因、家庭变故等），应及时向司法机关说明情况，并提供相关证明材料。这样既可以避免不必要的法律纠纷，也可以体现对司法机关的尊重和合作。

总结与建议：目击证人在理论上具有不配合公安机关调查的权利，但在刑事诉讼中经法院通知无正当理由拒不出庭作证时，可能会面临法律后果。因此，建议目击证人在实际操作中尽量配合司法机关的调查工作，并在确实存在无法配合的情况时及时说明并提供相关证明材料。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。