针对您提出的“学校租的车做保养可以开专票吗，合法吗”这一问题，我将从以下几个方面进行详细解答：
一、能否开具专票
学校租用的车辆进行保养，本质上属于接受服务的一种。根据增值税的相关规定，如果提供保养服务的供应商是一般纳税人，并且该保养服务属于其应税范围，那么在符合一定条件下（如学校为一般纳税人且需要用于可抵扣项目），是可以要求供应商开具增值税专用发票（专票）的。专票可以用于学校后续的增值税进项税额抵扣（如果学校有增值税应税业务且符合抵扣条件）。
二、合法性分析
发票开具的合法性：
- 根据《中华人民共和国发票管理办法》的规定，销售商品、提供服务以及从事其他经营活动的单位和个人，对外发生经营业务收取款项时，收款方应当向付款方开具发票。因此，保养服务供应商有义务根据实际业务情况开具发票。
- 发票的开具应当遵循规定的时限、顺序、栏目，全部联次一次性如实开具，并加盖发票专用章。这意味着，只要保养服务真实发生，且供应商具备开具专票的资格，那么开具专票就是合法的。
专票使用的合法性：
- 学校作为付款方，如果其有增值税应税业务且需要用于可抵扣项目，那么接受专票并用于抵扣也是合法的。但需要注意的是，专票的抵扣必须符合增值税的相关规定，如不得用于非增值税应税项目、免征增值税项目等。
三、实际操作建议
确认供应商资格：
- 在与保养服务供应商签订合同前，应确认其是否为一般纳税人，并了解其是否具备开具专票的资格。
明确发票要求：
- 在合同中应明确发票的开具要求，包括发票类型（专票或普票）、发票内容、开具时间等。
合规使用发票：
- 学校在收到专票后，应妥善保管并按照规定进行抵扣操作。同时，应确保专票的使用符合增值税的相关规定，避免因违规使用而引发税务风险。
综上所述，学校租用的车辆进行保养时，在符合一定条件下是可以要求供应商开具增值税专用发票的，并且这种做法在法律上是合法的。但学校在实际操作中应注意确认供应商资格、明确发票要求以及合规使用发票等事项。