针对您提出的问题，即“用房产证抵押借钱，但离婚协议写给儿子，法院会怎么判”，我们可以从以下几个方面进行详细分析：

1. 房产抵押的法律效力：

   • 首先，需要明确的是，房产证作为房屋所有权的法律凭证，其抵押行为需要遵循相关法律法规。如果房产证在抵押时并未明确标注或存在其他限制条件（如已被离婚协议约定给子女），那么从法律层面看，抵押行为本身在符合法定程序的情况下是有效的。但关键在于，这一抵押行为是否侵犯了离婚协议中约定的子女权益。

2. 离婚协议的法律约束力：

   • 离婚协议是夫妻双方在离婚时对财产分割、子女抚养等问题达成的书面协议，具有法律约束力。如果离婚协议中明确约定了房产归子女所有，那么这一约定对夫妻双方均具有法律约束力，任何一方不得擅自变更或撤销。

3. 法院的判决原则：

   • 在处理此类纠纷时，法院会综合考虑多个因素，包括但不限于：抵押行为的合法性、离婚协议的明确性、子女的权益保护等。
   • 如果抵押行为发生在离婚协议之后，且未经子女或另一方同意，法院可能会认定抵押行为侵犯了子女的合法权益，从而判决抵押行为无效或要求抵押人承担相应的法律责任。
   • 如果抵押行为发生在离婚协议之前，但离婚协议中明确约定了房产归子女所有，且抵押人未在抵押时告知抵押权人这一约定，法院可能会根据具体情况判断抵押权人是否构成善意取得，进而决定抵押行为的效力。

4. 建议与措施：

   • 对于涉及此类纠纷的当事人，建议首先与对方协商解决，尽量达成和解协议，以减少不必要的法律纠纷和成本。
   • 如果协商无果，可以向法院提起诉讼，由法院根据具体情况进行判决。在诉讼过程中，当事人应提供充分的证据证明自己的主张，并遵守法院的诉讼程序和规定。

综上所述，法院在判决此类案件时会综合考虑多个因素，并依据相关法律法规进行裁决。如果您或您身边的人遇到此类问题，建议直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细、更有针对性的法律建议。