针对您提出的“公车私用的违纪款怎么处理”这一问题，以下是我为您提供的清晰、详细、有深度的解答：

公车私用，即将公务用车用于私人事务，是违反公车使用管理规定的行为，对此，我国法律法规和单位规章制度均明确了相应的处罚措施，特别是针对违纪款的处理。

一、违纪款的处理原则

公车私用所产生的费用，包括但不限于燃油费、过路费、停车费等，均应视为违纪款。这些费用原则上应由当事人承担，不得由单位或公共资金支付。同时，监察部门或单位内部还可能根据违纪情节的严重程度，对当事人处以额外的罚款或要求退缴违纪所得。

二、具体处理措施

1. 经济处罚：

   • 当事人需承担公车私用期间产生的所有费用，包括直接费用和间接费用（如因公车私用导致的车辆损耗、维修费用等）。
   • 监察部门或单位内部可能根据违纪情节，对当事人处以一定数额的罚款，罚款金额通常与违纪款的数额和违纪情节的严重程度相关。

2. 纪律处分：

   • 根据违纪情节的严重程度，当事人可能受到党纪处分（如警告、严重警告、撤销党内职务等）或政务处分（如警告、记过、降级、撤职、开除等）。
   • 单位内部还可能对当事人进行批评教育、扣发绩效奖金、取消评优评先资格等纪律处理。

3. 组织处理：

   • 对于情节较轻的公车私用行为，单位可能给予通报批评、责令检讨、诫勉谈话等组织处理措施。
   • 对于情节严重的公车私用行为，单位可能进行问责处理，甚至追究相关人员的法律责任。

4. 刑事责任追究：

   • 若公车私用行为情节特别严重，如导致严重交通事故、造成重大人员伤亡或财产损失，或引发社会强烈负面反响、严重损害政府或单位形象，涉事人员可能面临交通肇事罪、滥用职权罪等刑事责任的追究。

三、实际案例参考

以山西省纪委监委公开曝光的违规配备使用公车问题为例，多名公职人员因公车私用受到党内严重警告、撤职等处分，并被责令退缴违纪所得。这些案例充分说明了公车私用行为的严重性和处理力度。

四、建议与总结

公车私用是一种严重的违纪违法行为，不仅损害了公共利益和单位形象，还可能触犯法律。因此，各单位应加强对公务用车的管理和监督，建立健全相关制度，确保公务用车的规范使用。同时，公职人员也应自觉遵守相关规定，做到公私分明、廉洁自律，共同维护良好的社会风气和单位形象。对于已经发生的公车私用行为，单位应依法依规进行处理，确保违纪款得到妥善处理，违纪人员受到应有的惩罚。