针对您提出的“药店在被行政处罚立案后能否申请换证许可”的问题，以下是我的详细解答：

首先，我们需要明确的是，药店在被行政处罚立案后，其换证许可的申请会受到一定影响。根据相关法律法规及政策规定，如果药店因违法经营已被药品监管部门立案调查，且尚未结案，或者已经作出行政处罚决定但尚未履行处罚的，那么其换发《药品经营许可证》的申请通常会被暂停受理。

具体来说，以海南省为例，根据海南省药品监督管理局发布的关于《药品经营许可证》换发有关工作的通知，明确规定了企业因违法经营已被药品监管部门立案调查，尚未结案的；或者已经作出行政处罚决定，尚未履行处罚的，行政审批办会暂停受理其换发《药品经营许可证》的申请。这一规定旨在确保药品经营企业的合规性，维护药品市场的秩序和安全。

此外，即使药店未被立案调查或已履行处罚，但在换证过程中，如果存在上次换发证签发日期至今因违法行为受到药品监管部门行政处罚的，或者经营范围包含特殊药品（如麻醉药品、精神药品等）等情形，也可能需要进行现场检查，以确保药店的经营活动符合相关法规和规范。

对于药品零售企业而言，虽然部分地区对药品零售企业许可换证实行了告知承诺制，但这并不意味着所有药店都能轻松通过换证申请。告知承诺制通常要求药店在上一个许可周期内没有违法违规经营的行为，且需要声明经营条件及周边环境未发生变化（或虽发生变化但已通过现场核查）。如果药店存在违法违规行为或经营条件发生变化且未通过核查，那么其换证申请也可能受到阻碍。

综上所述，药店在被行政处罚立案后，其换证许可的申请通常会受到暂停受理的处理。为了确保换证申请的顺利进行，药店应严格遵守相关法律法规和规范要求，积极配合药品监管部门的调查和检查工作，并在问题解决后及时提交换证申请。同时，药店也应加强内部管理，提高合规经营水平，以避免类似问题的再次发生。