单位一般不得因员工患有小三阳而将其辞退。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
从法律保护的角度来看：
- 根据《中华人民共和国劳动法》、《中华人民共和国劳动合同法》及《就业促进法》等相关法律法规，劳动者享有平等就业和选择职业的权利，用人单位招用人员时，不得对传染病病原携带者进行歧视。小三阳作为乙肝病毒携带状态，并不等同于具有传染性，因此，在治愈前或排除传染嫌疑前，除非从事法律、行政法规和国务院卫生行政部门明确禁止的易使传染病扩散的工作，用人单位不得强行辞退此类员工。
从特殊行业规定的角度来看：
- 对于食品、餐饮、医疗、幼教等可能涉及公共卫生的特殊行业，小三阳患者确实可能面临一定的就业限制。然而，这并不意味着他们无法获得健康证或完全无法就业。具体能否从业需依据患者的肝功能状况、乙肝病毒复制活跃度及DNA检测结果来判断。若患者病情不影响正常工作，能胜任工作任务，且不存在其他违反单位规章制度等法定解除劳动合同的情形，单位无权随意辞退。
从劳动合同法的具体条款角度来看：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十二条，劳动者患病或者非因工负伤，在规定的医疗期内，用人单位不得依照该法第四十条、第四十一条的规定解除劳动合同。同时，第三十九条所列举的可解除劳动合同的情形中，并未包含小三阳这一状况。因此，单位以小三阳为由辞退员工，可能构成违法解除劳动合同。
从维权途径的角度来看：
- 若单位以小三阳为由违法辞退员工，员工首先应与用人单位协商，要求停止歧视行为并恢复工作关系。协商无果时，可向当地劳动监察部门投诉，由其对投诉进行调查核实并依法处理。员工还可寻求法律援助，通过劳动仲裁或诉讼等法律途径维护自身合法权益。若胜诉，员工有权要求单位恢复劳动关系或获得相应的经济赔偿金（通常按经济补偿标准的二倍支付）。
法律建议：
- 作为员工，若被查出患有小三阳，应积极了解自己的权益，并保留好相关证据，如劳动合同、工作记录、辞退通知等，以便在需要时维护自身合法权益。
- 作为单位，应严格遵守相关法律法规，不得对传染病病原携带者进行歧视，确保员工的平等就业权利。
可能的法律后果：
- 若单位违法辞退患有小三阳的员工，可能面临劳动仲裁或诉讼的风险，并需承担相应的法律责任，包括恢复劳动关系或支付经济赔偿金等。
综上所述，单位一般不得因员工患有小三阳而将其辞退。若遇到此类情况，员工应积极运用法律武器维护自己的权益。如有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。