针对您提出的“非法码头建设怎么处罚”的问题，以下是一个清晰、详细且有深度的解答：
非法码头建设的处罚主要依据相关法律法规进行，具体处罚措施和程序可能因地区和违法情节的不同而有所差异。但一般来说，非法码头建设会面临以下处罚：
一、处罚依据
《中华人民共和国海域使用管理法》：
- 该法明确规定，单位和个人使用海域，必须依法取得海域使用权。未经批准或者骗取批准，非法占用海域的，将受到严厉处罚。
《中华人民共和国港口法》：
- 该法规定，违反港口规划建设港口、码头或者其他港口设施，或者未经批准建设港口设施使用港口岸线的，将由县级以上地方人民政府或者港口行政管理部门责令限期改正；逾期不改正的，将申请人民法院强制拆除违法建设的设施，并可以处五万元以下罚款。
二、处罚措施
责令停止违法行为：
- 对于非法码头建设，相关部门首先会责令建设者立即停止违法行为，防止违法行为的进一步扩大。
责令改正违法行为：
- 建设者需要在规定的期限内对非法码头进行整改，使其符合相关法律法规和规划要求。
罚款：
- 根据违法情节的严重程度，相关部门会对建设者处以一定数额的罚款。罚款金额可能因地区和违法情节的不同而有所差异，但一般会在一定范围内（如五万元以下）。
强制拆除：
- 如果建设者在规定的期限内未改正违法行为，相关部门将申请人民法院强制拆除违法建设的设施。
三、案例参考
以某港口发展公司违法占用海域行政处罚案为例，该公司擅自新增了3根防护桩，超出原批复用海范围约8.9米，违法占用海域面积0.0634公顷。最终，上海市海洋局对该公司作出了责令停止违法行为、责令改正违法行为并处罚款人民币32219.62元的行政处罚。当事人在收到行政处罚决定书后，立即补办了相应的用海手续，及时缴纳了罚款。
四、建议与启示
提高依法用海、依法施工意识：
- 海域使用权人在开发利用海域时，应当严格遵守相关法律法规和规划要求，提高依法用海、依法施工的意识。
及时办理变更手续：
- 如果在施工过程中发现需要变更用海内容（如用海方式、用海面积、用海期限等），应当及时与用海论证单位及相关海洋行政管理部门进行沟通协调，并办理相应的变更手续。
积极参与共同监督：
- 鼓励市民群众积极参与共同监督，发现非法码头建设等违法行为时，可通过相关渠道进行举报。
综上所述，非法码头建设将面临严厉的处罚措施。因此，建议相关建设者在开发利用海域时严格遵守相关法律法规和规划要求，确保用海行为的合法合规。