针对您提出的“合作协议后来重新写了，第一份协议还有效吗”这一问题，我的分析如下：
结论前置：
- 一般情况下，新协议生效后，旧协议即失效，但需根据具体情况判断。
详细分析：
在合同纠纷领域，合作协议的效力问题是一个核心议题。当双方就同一事项重新签订了合作协议时，第一份协议的效力通常取决于新协议的内容以及双方的意图。
新协议明确替代旧协议：
- 如果新协议中明确表述了该协议将替代之前签订的所有协议，或者双方在新协议签订时以口头或书面形式明确表示了旧协议不再有效，那么在这种情况下，第一份协议通常会被视为已经失效。
新协议未明确提及旧协议：
- 如果新协议中并未明确提及旧协议，也未表明其将替代旧协议，那么旧协议的效力就需要根据具体情况来判断。例如，如果新协议只是对旧协议中的某些条款进行了修改或补充，而并未涉及旧协议的全部内容，那么旧协议中未被修改或补充的部分仍然可能有效。
双方的实际履行情况：
- 除了协议本身的内容外，双方的实际履行情况也是判断旧协议是否仍然有效的重要因素。如果双方在新协议签订后，仍然按照旧协议的约定进行履行，或者新协议的履行与旧协议存在紧密的关联，那么旧协议的某些条款可能仍然会被视为有效。
法律规定的特殊情况：
- 在某些特殊情况下，即使双方签订了新的合作协议，旧协议中的某些条款也可能仍然有效。例如，如果旧协议中包含了关于保密义务、竞业禁止等长期有效的条款，那么这些条款在新协议签订后仍然可能继续有效。
法律建议：
- 在签订新的合作协议前，建议双方对旧协议进行全面的审查和评估，明确新协议与旧协议之间的关系以及旧协议的效力问题。
- 如果双方对旧协议的效力存在争议，或者新协议的签订可能影响旧协议的效力，建议及时咨询专业律师，以便在签订新协议前妥善解决相关问题。
总结：
合作协议后来重新写了，第一份协议是否还有效，需要根据新协议的内容、双方的意图以及实际履行情况等多个因素进行综合判断。如果您在合同纠纷领域有任何法律问题，可以直接向我咨询，我将为您提供专业的法律意见和解决方案。