在二审中，如果当事人超过举证期限进行举证，法院的处理方式会根据证据的性质有所不同。以下是对这一问题的详细解答：
首先，我们需要明确的是，根据《民事诉讼法》的相关规定，当事人对自己提出的主张应当及时提供证据。在二审阶段，当事人同样需要在合理期限内完成举证，否则可能会承担不利后果。
当证据属于新证据时：
- 如果该证据是在一审庭审结束后才新发现的，或者是因客观原因无法在一审举证期限内提供，并且经过一审法院准许未提供的证据等，这些都被视为新证据。
- 对于新证据，法院会组织质证，即允许双方当事人对该证据进行辩论和审查，以确定其真实性和关联性。
当证据不属于新证据时：
- 如果证据不属于新证据，且当事人超过举证期限进行举证，法院有可能不予采纳该证据。
- 在这种情况下，如果对方不同意质证，法院一般不会主动组织质证，这意味着该证据很难被采纳作为认定事实的依据。
以小何与小李的合同纠纷案为例：
- 小何在一审判决后提起上诉，并在二审期间提交了一份超过举证期限的证据。
- 小李认为小何逾期举证，不同意对该证据进行质证。
- 如果该证据不符合新证据的条件，法院通常不会主动组织质证，此证据也就难以被采纳作为认定事实的依据。
- 在这种情况下，小何可能会因为超期举证而承担不利后果。
因此，为了避免超期举证带来的不利影响，当事人在二审举证时应尽量在规定期限内完成举证工作。如果确实有新证据需要提交，应及时与法院沟通并说明情况，以便法院能够根据实际情况进行妥善处理。