当员工在工厂工作中因工伤被鉴定为九级伤残时，公司确实需要承担相应的赔偿责任。以下是对这一问题的详细解答：

一、赔偿内容概述

赔偿内容主要根据公司是否为员工缴纳了工伤保险而有所不同。

1. 公司已缴纳工伤保险

• 一次性伤残补助金：由工伤保险基金支付，标准为9个月的本人工资（这里的本人工资指的是工伤前12个月的平均月缴费工资）。
• 停工留薪期工资：在员工因工伤暂停工作接受治疗期间，公司需按原来的工资福利待遇标准支付停工留薪期工资，保障员工的基本生活。停工留薪期一般不超过12个月，特殊情况可适当延长，但延长不得超过12个月。
• 医疗费用与康复费用：包括诊疗费、药费、住院费等治疗及康复所需费用，需符合工伤保险相关目录和标准，由工伤保险基金支付。
• 护理费：如果员工在停工留薪期需要护理，而公司未派人护理，那么相关护理费等费用需由公司承担。
• 一次性工伤医疗补助金：在劳动、聘用合同期满终止或职工提出解除合同时，由工伤保险基金支付，具体标准由省、自治区、直辖市人民政府规定。
• 一次性伤残就业补助金：同样在劳动、聘用合同期满终止或职工提出解除合同时支付，但由用人单位（即公司）支付，具体数额各地不同，通常结合当地职工平均工资等算出来。

2. 公司未缴纳工伤保险

若公司未为员工缴纳工伤保险，则所有原本由工伤保险基金支付的费用均需由公司承担，包括但不限于：

• 一次性伤残补助金
• 医疗费用与康复费用
• 停工留薪期工资
• 护理费
• 一次性工伤医疗补助金
• 一次性伤残就业补助金

此外，公司还可能需支付交通费、食宿费等合理费用。

二、赔偿流程

1. 工伤认定：单位应在事故伤害发生之日起30日内申请工伤认定，特殊情况经同意可适当延长。如单位未申请，员工或其近亲属可在1年内自行申请。
2. 劳动能力鉴定：完成工伤认定后，需进行劳动能力鉴定，确定伤残等级为9级。
3. 赔偿协商与支付：根据是否缴纳工伤保险，确定赔偿项目和支付方，并进行赔偿协商。协商不成可申请劳动仲裁，对仲裁结果不服还可向法院提起诉讼，通过法律途径解决赔偿纠纷。

三、注意事项与建议

1. 准确计算赔偿金额：赔偿金额需根据员工的实际情况、工资水平、伤残等级及当地法律法规和政策确定。
2. 积极沟通协商：公司应积极与员工沟通协商，按照法定程序进行赔偿，避免争议。
3. 咨询专业意见：在处理具体案件时，建议咨询当地的劳动保障部门或专业律师，确保赔偿的准确性和合法性。
4. 依法缴纳工伤保险：公司应依法为员工缴纳工伤保险费，以降低风险并确保员工权益。

综上所述，对于九级工伤伤残的赔偿，公司需根据是否缴纳工伤保险来确定具体的赔偿责任和支付方。同时，公司应积极履行法定义务，确保员工在发生工伤时能够得到及时的救治和合理的赔偿。