针对您提出的“合同开发票清单和合同实际清单不一致，但金额是一致的，合同里怎么描述”这一问题，以下是我的详细解答：
在合同中，当出现开发票清单与合同实际清单不一致，但金额保持一致的情况时，为了确保交易的透明性和合法性，同时避免未来可能产生的纠纷，您可以在合同中增加一条专门的条款来对此进行说明。以下是一个建议的条款描述：
“发票与清单差异说明：
双方确认，本合同项下的交易金额以本合同约定的金额为准。在开具发票时，由于商品/服务的具体分类、明细或税务处理等原因，发票上的清单可能与本合同所附的实际清单存在差异。但双方明确，此类差异并不影响本合同约定的交易金额，且发票总金额与本合同约定的交易金额保持一致。双方同意，此类差异不构成对本合同任何条款的违反，也不影响双方在本合同项下的权利和义务。”
通过这样的条款描述，您可以：
明确金额一致性：强调发票总金额与合同金额的一致性，消除对金额差异的疑虑。
解释清单差异原因：简要说明发票清单与合同实际清单可能存在差异的原因，如商品/服务的具体分类、明细或税务处理等。
避免纠纷：明确此类差异不构成对合同条款的违反，也不影响双方的权利和义务，从而减少未来可能产生的纠纷。
此外，为了进一步确保交易的合法性和透明性，建议您在合同执行过程中：
保持沟通：与对方保持密切沟通，确保双方对交易细节和发票开具都有清晰的理解。
留存证据：妥善保存与交易有关的所有证据，如合同、补充协议、发票等，以便在需要时提供有力支持。
遵守税法：确保发票的开具和税务处理都符合相关税法规定，避免因税务问题导致的法律风险。
综上所述，通过在合同中增加专门的条款来描述发票与清单的差异情况，并采取相应的措施来确保交易的合法性和透明性，您可以有效地解决这一问题并减少未来可能产生的纠纷。