关于合同签订后经双方商量付最后百分之95款是否有效的问题，结论是：这样的约定在符合法律规定和双方真实意思表示的情况下是有效的。

1. 从合同法的角度来看：

   • 根据《中华人民共和国民法典》合同编的相关规定，合同是双方当事人意思表示一致的协议，只要合同内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，且双方当事人具有相应的民事行为能力，那么合同就是有效的。
   • 在您提到的情况中，双方经过商量后约定在合同签订后支付最后百分之95的款项，这是双方真实意思表示的体现，且没有违反法律的强制性规定，因此这样的约定在法律上是有效的。

2. 从实际操作的角度来看：

   • 双方在合同中明确约定了付款方式和时间，这是合同履行的重要部分。只要双方都按照合同约定来履行自己的义务，那么合同就能够顺利执行。
   • 如果一方在合同履行过程中违反了约定，比如没有按时支付款项，那么另一方有权根据合同约定和法律规定来追究违约方的责任。

3. 需要注意的事项：

   • 虽然这样的约定在法律上是有效的，但双方在签订合同时还是应该尽量明确、具体地约定付款方式和时间，以避免后续可能出现的纠纷。
   • 如果合同中涉及到金额较大或者付款方式较为复杂的情况，建议双方在签订合同前咨询专业的律师或者法律顾问，以确保合同的合法性和有效性。

综上所述，合同签订后经双方商量付最后百分之95款的约定在符合法律规定和双方真实意思表示的情况下是有效的。但双方在签订合同时还是应该谨慎对待，确保合同的合法性和有效性。如果您有任何关于合同纠纷的法律问题，可以直接向我咨询。