针对您提出的“一个项目经理备案了两个项目怎么办”的问题，这确实是一个涉及项目管理规范和法规要求的重要议题。以下是我为您提供的清晰、详细、有深度的解答：
首先，我们需要明确的是，根据《注册建造师管理规定》以及《注册建造师执业管理办法》（试行）的相关规定，注册建造师（即项目经理）在一般情况下是不得同时在两个及两个以上的建设工程项目上担任施工单位项目负责人的。这是为了确保每个项目都能得到充分的关注和管理，从而保障项目的顺利进行和高质量完成。
然而，也存在一些特殊情况，允许注册建造师同时担任两个及以上建设工程施工项目负责人，这些情况包括但不限于：
对于您提到的项目经理备案了两个项目的情况，我们需要具体分析这两个项目的性质、施工进度以及项目经理的参与程度。如果这两个项目符合上述特殊情况之一，或者项目经理能够提供充分证据证明其有能力同时管理这两个项目，并且不会对任何一个项目的进度和质量造成负面影响，那么这种情况可能是被允许的。
但如果不符合上述特殊情况，或者项目经理无法提供充分证据证明其管理能力，那么这种行为就可能违反了相关规定。在这种情况下，建设单位或相关监管部门有权对项目经理进行质疑，并要求其作出解释或采取补救措施。如果项目经理不能提供有效证据或作出合理说明，那么其所在公司的中标结果可能会被视为无效，或者项目经理可能会面临相应的处罚。
此外，对于对外承包工程项目，企业还需要按照《对外承包工程项目备案和立项管理办法》等相关规定办理项目备案（立项）手续，并报告项目后续情况。这是为了确保项目的合法性和规范性，同时也是为了保障企业的利益和声誉。
综上所述，针对项目经理备案了两个项目的情况，我们需要具体分析项目的性质、施工进度以及项目经理的参与程度，并参考相关法规和规定进行判断和处理。如果项目经理的行为违反了相关规定，那么建设单位或相关监管部门有权采取相应的措施进行纠正和处罚。同时，企业也需要加强内部管理，确保项目经理的行为符合法规和规定的要求。