针对您提出的“审计查出工资重复发放怎么办”这一问题，以下是一个清晰、详细且有深度的解答：

当审计查出工资重复发放的情况时，这通常意味着在工资发放过程中存在管理或操作上的失误，导致员工在一段时间内获得了不应得的额外收入。针对这种情况，可以采取以下步骤来妥善处理：

1. 核实情况：

   • 首先，需要仔细核对工资发放记录和相关财务凭证，确认重复发放的具体金额、涉及的员工以及时间范围。
   • 同时，与涉及的员工进行沟通，了解他们是否知晓重复发放的情况，以及是否有任何误解或特殊情况需要说明。

2. 制定整改方案：

   • 根据核实的情况，制定详细的整改方案。这包括确定需要追回的重复发放工资金额、追回的方式（如直接从员工工资中扣除、要求员工主动退还等）以及追回的时间表。
   • 如果涉及的员工较多或金额较大，可能需要考虑分阶段进行追回，以减轻员工的经济压力。

3. 与员工沟通并执行整改：

   • 与涉及的员工进行正式沟通，解释重复发放工资的情况以及整改方案。确保员工理解并同意整改措施。
   • 执行整改方案，按照既定的时间和方式追回重复发放的工资。

4. 加强内部管理和监督：

   • 针对此次重复发放工资的问题，深入分析原因，可能是工资发放流程存在漏洞、财务审核不严格或信息沟通不畅等。
   • 根据分析结果，加强内部管理和监督，完善工资发放流程、加强财务审核、建立信息共享机制等，以防止类似问题再次发生。

5. 建立长效机制：

   • 考虑建立长效机制来预防和应对工资重复发放等类似问题。例如，可以定期对工资发放记录进行审计和核查，确保工资发放的准确性和合规性。
   • 同时，加强员工对工资发放政策和流程的了解和培训，提高员工的合规意识和操作水平。

以随州市曾都区审计局和三台县审计局的处理为例，他们都通过核实情况、制定整改方案、与员工沟通并执行整改、加强内部管理和监督以及建立长效机制等步骤，成功解决了工资重复发放的问题，并维护了资金的安全和合规性。

综上所述，当审计查出工资重复发放时，应迅速采取行动，核实情况、制定整改方案、与员工沟通并执行整改、加强内部管理和监督以及建立长效机制，以确保问题得到妥善解决并防止类似问题再次发生。