针对您提出的“合作社未办理备案建设厂房怎么处罚”的问题，以下是我的详细解答：
首先，合作社作为市场主体，在建设厂房等固定资产投资项目时，需要遵循相关的法律法规和政策要求。其中，办理备案手续是确保项目合法、合规进行的重要一环。如果合作社未按照规定办理备案手续就擅自建设厂房，那么这种行为就构成了违法违规。
对于合作社未办理备案建设厂房的处罚，具体会依据相关法律法规和政策规定来执行。一般来说，处罚措施可能包括但不限于以下几个方面：
责令改正：相关部门会要求合作社立即停止建设，并补办备案手续。这是对合作社违法违规行为的一种直接纠正措施。
罚款：根据违法违规的严重程度和造成的后果，相关部门可能会对合作社处以一定数额的罚款。罚款的数额会根据具体情况来确定，旨在起到警示和惩戒的作用。
其他行政处罚：除了责令改正和罚款外，相关部门还可能根据具体情况采取其他行政处罚措施，如吊销营业执照、限制市场准入等。这些措施旨在进一步加强对合作社违法违规行为的惩戒力度。
需要注意的是，具体的处罚措施和标准会因地区、行业以及违法违规的严重程度而有所不同。因此，在处理此类问题时，建议合作社积极与相关部门沟通，了解具体的处罚规定和程序，并主动配合整改工作。
此外，为了避免类似问题的再次发生，合作社在未来的经营活动中应严格遵守相关法律法规和政策要求，加强内部管理，确保所有项目都合法、合规进行。同时，合作社也可以积极寻求专业法律咨询和帮助，以更好地维护自身权益和合法经营。