药店因药品过期被查处，即便提交了申诉，仍有可能面临处罚。以下从多个角度为你详细分析：
一、法律责任与处罚依据
行政责任：
- 根据《中华人民共和国药品管理法》等相关法律法规，药店销售过期药品属于违法行为，药品监督管理部门有权对其进行查处，并可能给予警告、罚款、没收违法所得、责令停业整顿直至吊销药品经营许可证等处罚。
- 提交申诉是药店的权利，但申诉本身并不免除其因违法行为而应承担的法律责任。申诉期间，药品监督管理部门仍会依法进行调查和处理。
民事责任：
- 如果过期药品给消费者造成了人身损害或财产损失，药店还可能面临消费者的民事赔偿要求。
二、申诉的作用与影响
申诉的目的：
- 药店提交申诉，主要是为了对药品监督管理部门作出的处罚决定提出异议，要求重新审查或说明情况。
申诉对处罚的影响：
- 申诉并不直接导致处罚的暂停或撤销。药品监督管理部门在收到申诉后，会进行审查，并根据审查结果决定是否维持、变更或撤销原处罚决定。
- 在申诉期间，如果药店能够积极配合调查，主动采取措施纠正违法行为，并证明其已尽到合理的注意义务，这可能会在一定程度上影响处罚的轻重，但并不意味着可以完全免除处罚。
三、药店应采取的措施
积极配合调查：
- 药店应如实向药品监督管理部门提供相关证据和资料，积极配合调查工作。
主动纠正违法行为：
- 药店应立即停止销售过期药品，对库存药品进行全面检查，确保不再销售过期药品。
加强内部管理：
- 药店应建立健全药品管理制度，加强药品采购、验收、储存、销售等环节的监管，确保药品质量安全。
寻求专业法律帮助：
- 如有需要，药店可以寻求专业律师的法律帮助，以更好地应对处罚和申诉事宜。
综上所述，药店因药品过期被查处后，即便提交了申诉，仍有可能面临处罚。药店应积极配合调查、主动纠正违法行为、加强内部管理，并在必要时寻求专业法律帮助。如果你有进一步的法律问题或需要更具体的法律建议，可以直接向我咨询。