当药店被查出有过期药品时，处罚措施会根据相关法律法规及具体情况而定。以下是对此问题的详细解答：

一、主要法律法规依据

1. 《中华人民共和国药品管理法》：该法明确规定，禁止生产、销售劣药。过期药品被视为劣药，因此销售过期药品是违法的。根据该法第一百一十七条，对于生产、销售劣药的，将没收违法生产、销售的药品和违法所得，并处以货值金额十倍以上二十倍以下的罚款。如果货值金额不足一万元，将按一万元计算罚款。情节严重的，还可能被责令停产停业整顿，甚至吊销药品相关许可证。

2. 《中华人民共和国刑法》：若销售过期药品的行为情节严重，可能触犯刑法中的相关罪名，如生产、销售伪劣产品罪或生产、销售假药罪（具体罪名视情况而定），将面临有期徒刑、拘役、罚金等刑罚。

二、处罚措施

1. 行政处罚：

   • 没收违法所得：包括已售出的过期药品的销售额以及未售出但已购进的过期药品的价值。
   • 罚款：根据违法行为的严重程度，处以货值金额一定倍数的罚款。货值金额不足一万元的，通常并处二万元以上五万元以下罚款；货值金额一万元以上的，并处货值金额十倍以上二十倍以下罚款。
   • 吊销许可证：如果情节严重，将吊销药店的《药品经营许可证》，取消其经营资格。
   • 责令改正：要求药店立即停止销售过期药品，并采取措施消除危害后果，如召回已售出的过期药品等。

2. 刑事责任：

   • 如果销售过期药品的金额较大或造成严重后果，可能构成犯罪。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，将依法追究刑事责任，可能处以有期徒刑、拘役、罚金等刑罚。

三、实际案例与社会影响

近年来，多地市场监管部门对药店销售过期药品的行为进行了严厉打击，查处了多起案件，并对涉案药店和相关责任人给予了相应的行政处罚。这些案例表明，监管部门对药品安全高度重视，对违法行为将依法严惩不贷。

销售过期药品不仅损害了消费者的合法权益，也破坏了药品市场的正常秩序。因此，必须依法严惩此类违法行为，以保障公众用药安全和维护药品市场的健康发展。

综上所述，药店被查出有过期药品时，将面临严格的法律处罚。为了避免这种情况的发生，药店应严格遵守相关法律法规，加强药品管理，确保药品的安全有效。