如果公司员工的银行卡因司法冻结、风控等原因被冻结超过三个月，公司可以采取以下措施：

1. 了解冻结原因：

   • 公司应首先与被冻结银行卡的员工进行沟通，了解银行卡被冻结的具体原因。这包括但不限于司法冻结（如涉及诉讼、执行案件）、银行风控（如可疑交易、账户异常）等。

2. 协助员工与相关部门沟通：

   • 公司可以协助员工与冻结银行卡的银行或司法机关进行沟通，了解冻结的详细情况，并询问解冻的具体流程和所需材料。
   • 对于司法冻结，公司可以引导员工联系执行法院或相关司法机关，了解冻结的法律依据、解冻条件以及解冻申请的程序。

3. 准备解冻所需材料：

   • 根据银行或司法机关的要求，公司可以协助员工准备解冻所需的材料，如身份证明、银行卡信息、冻结通知书、解冻申请书等。

4. 关注解冻进展并跟进：

   • 公司应持续关注员工银行卡的解冻进展，并与员工保持沟通，及时了解解冻申请的审核情况。
   • 如果解冻申请被拒绝或需要补充材料，公司应协助员工及时采取相应措施。

5. 考虑公司内部调整或支持：

   • 如果员工的银行卡被冻结导致其无法正常接收工资或进行其他与公司相关的财务交易，公司可以考虑调整工资发放方式（如通过其他银行账户发放）或提供其他形式的财务支持。

6. 法律风险防范与合规：

   • 公司应确保在处理员工银行卡被冻结的问题时，遵守相关法律法规和银行规定，避免因处理不当而引发法律风险或合规问题。

作为{lawyerName}律师，我擅长处理公司法律事务及员工权益保护等相关问题。如果公司在处理员工银行卡被冻结的问题时遇到任何法律难题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。