针对外国人继承内资公司股权纠纷案件的处理，以下是我的详细解答：

一、外国人继承内资公司股权的合法性

1. 股东资格的继承：根据我国《公司法》及相关规定，内资公司的自然人股东死亡后，其具有外国国籍的合法继承人可以继承股东资格，但公司章程另有规定的除外。这意味着，除非公司章程明确限制了股东资格的继承，否则外国籍继承人有权继承内资公司的股权并取得股东资格。

2. 股权的性质：股权作为一种财产权，属于被继承人的合法财产之一，因此可以被继承。股东资格则是基于股权这种财产权的内容而产生的，包含身份权和财产权两部分。在继承过程中，身份权可能随着财产权一并转让，因此股东资格可以被继承。

二、纠纷案件的处理

1. 诉讼程序：若发生外国人继承内资公司股权的纠纷，当事人可以向有管辖权的法院提起诉讼。一般来说，股权转让纠纷属于民事诉讼类，法院在审判时会考虑当事人所在区域、公司所在区域等因素来决定由哪个法院来审判。

2. 公司章程的审查：在处理此类纠纷时，法院会首先审查公司章程是否对股东资格的继承作出了限制性规定。若公司章程未作限制，则外国籍继承人有权继承股东资格；若公司章程作出了限制，则继承人可能只能取得股权而不能取得股东资格，但可以通过转让股权来实现财产继承。

3. 外资公司的判断标准：在我国，外资公司的判断标准一般以注册资本来源地为原则。因此，即使股东的国籍发生变化或已死亡股东的合法继承人为外国国籍，只要公司的注册资本全部来源于国内，公司仍属于内资公司，无需获得外资管理部门的批准。

三、法律建议

1. 完善公司章程：为避免未来可能发生的纠纷，建议内资公司在公司章程中明确股东资格的继承规定，包括是否允许外国籍继承人继承股东资格等。

2. 及时办理股权变更登记：在继承人取得股权后，公司应积极承担办理股权变更登记手续的义务，确保继承人的合法权益得到保障。

3. 寻求专业法律帮助：若在处理外国人继承内资公司股权纠纷案件时遇到法律难题，建议及时咨询专业律师以获取更准确的法律建议和帮助。

综上所述，外国人继承内资公司股权纠纷案件的处理需要综合考虑法律规定、公司章程以及实际情况等因素。在处理此类纠纷时，应确保继承人的合法权益得到保障，并遵循相关法律法规和程序进行操作。如有任何法律问题，欢迎直接向我咨询。