村里收取建房保证书是否合法，需根据具体情况综合判断，以下从不同角度进行分析：
一、不合法的情形
违反法律法规：
- 农村村民享有按照规定申请宅基地并建房的权利，宅基地的分配应基于村民的集体经济组织成员身份等法定条件。村委会若未经批准擅自以“建房保证书”为由向村民收取费用，可能属于乱收费行为，违反了《村民委员会组织法》《土地管理法》等相关法律法规。
侵犯村民权益：
- 此种收费行为可能剥夺了经济困难村民公平获得宅基地建房的机会，进而侵犯了其居住权益。高额或不合理的费用可能给村民造成过大的经济负担，损害其合法权益。
程序不合法：
- 若村里收取建房保证书的行为未经过村民会议或村民代表会议的讨论和决定，或未进行公示，则该收费行为不具备合法性基础。
费用使用不当：
- 若所收费用未被用于与建房相关的公共基础设施建设、土地整理等公共利益事项，而是被私自挪用或侵占，则此行为同样不合法。
二、可能合法的特殊情形
经合法程序：
- 如果村里收取建房保证书的行为已经过村民会议或村民代表会议的充分讨论和决定，并且符合相关法律法规的规定，那么该行为可能具有合法性。
用于公共利益：
- 所收费用必须明确用于村里的基础设施、公共设施建设或公益事业上，如改善村庄居住环境、统一进行道路、水电等基础设施建设等。同时，费用使用情况需进行公开透明的管理和公示，接受村民的监督。
收费标准合理：
- 收费标准应考虑村民的经济承受能力，避免给村民造成过大的经济负担。若收费标准合理且透明，那么该行为可能更易被接受为合法。
三、法律建议
若村民认为村里收取建房保证书的行为存在不合法或不合理之处，可采取以下措施维护自身权益：
向相关部门反映：
- 向乡镇政府、县级农业农村部门等相关政府部门反映情况，请求调查处理。
咨询法律意见：
法律途径维权：
- 若情况严重，可通过法律途径维护自身权益，如提起行政诉讼或民事诉讼等。
综上所述，村里收取建房保证书是否合法需根据具体情况综合判断。村民应密切关注村里的决策过程和费用使用情况，确保自身权益不受侵害。如遇问题，应及时采取措施维护自身合法权益。