两个产权人一方自建消防系统拒绝另一方使用是不合法的。以下是具体的分析：

首先，从产权的角度来看，如果两个产权人共同拥有某一房产，那么他们对该房产都享有相应的权利。消防系统作为房产的一部分，其使用应当遵循共同共有的原则，即双方都有权使用，而一方不能单方面拒绝另一方使用。

其次，从消防安全的角度来看，消防系统是为了保障整个房产的消防安全而设立的。如果一方拒绝另一方使用消防系统，那么可能会对整个房产的消防安全造成隐患。这不仅违反了消防安全的相关规定，也可能对双方的生命财产安全构成威胁。

最后，从法律后果的角度来看，如果一方擅自拒绝另一方使用消防系统，那么另一方有权向法院提起诉讼，要求维护其合法权益。法院在审理此类案件时，会根据相关法律法规和事实情况，作出公正的裁决。

因此，两个产权人一方自建消防系统拒绝另一方使用是不合法的。双方应当遵循共同共有的原则，合理使用消防系统，确保房产的消防安全。如果双方存在争议，应当通过协商或法律途径解决。