当您在商店购买的商品在保质期内发生变质时，您有权进行索赔。以下是详细的索赔步骤和注意事项：

一、保留相关证据

首先，您需要保留变质商品本身以及购物凭证。变质商品应保持原状，不要破坏或处理变质部分，这是重要的物证。购物凭证可以包括发票、收据、购物小票或电子支付记录等，这些能证明您购买该商品的时间、地点和金额。

二、与销售者协商

接下来，您应主动联系商家，通过电话、邮件或在线客服等方式说明问题，并提供您所保留的证据。在协商过程中，您要明确自己的诉求，比如要求退货、换货、退款，以及赔偿因变质商品导致的其他损失（如交通费、医疗费等）。

三、寻求第三方调解

如果与商家协商无果，您可以寻求消费者协会或依法成立的其他调解组织的帮助，请求他们介入调解。

四、向行政部门投诉

若第三方调解仍然无法解决问题，您可以向消费者协会（拨打12315热线）或食品药品监督管理部门投诉。这些部门能够进行调查、检测和鉴定，并依法对商家进行查处。特别是当食品或药品变质时，向食品药品监督管理部门投诉是非常有效的途径。

五、提起仲裁或诉讼

如果以上方式都无法解决问题，您可以根据与商家达成的仲裁协议提请仲裁机构仲裁，或者直接向人民法院提起诉讼。在提起仲裁或诉讼前，请确保您已经准备了充分的证据材料，并明确提出了自己的诉讼请求。

六、赔偿标准

根据相关法律法规，消费者因购买不符合标准的商品受到损害时，可以向经营者要求赔偿损失。赔偿范围通常包括商品价款损失、其他直接损失（如医疗费、误工费），并且您还可以要求支付价款十倍或损失三倍的赔偿金。如果赔偿金不足一千元，则按一千元计算。

综上所述，当您在商店购买的商品在保质期内变质时，请务必保留好相关证据，并按照上述步骤与商家进行协商、调解、投诉或提起仲裁、诉讼。在索赔过程中，请依据相关法律法规要求合理的赔偿，以维护自己的合法权益。