结论前置：在光伏房顶租赁合同已经签订且电站已运行、租金已收取的情况下，合同的撤销并非简单之事，需依据具体情形来判断。若存在法定撤销事由，如欺诈、重大误解等，或双方协商一致，则有可能撤销合同。但若无正当理由单方撤销，将可能构成违约。

详细分析：

1. 协商解除：

   • 双方可首先尝试通过友好协商来解除合同。这需要双方就合同的解除及其后续事宜（如已收租金的退还、设备的拆除与归还等）达成一致意见，并签订书面的解除协议。

2. 法定解除：

   • 若合同存在法定撤销事由，如一方以欺诈手段使对方在违背真实意思的情况下签订合同（如虚假宣传光伏设备的收益、性能等），或合同存在重大误解（如对合同关键条款的理解有严重偏差），则受损害方有权请求人民法院或仲裁机构撤销合同。
   • 法定解除还需注意行使撤销权的时效限制。根据《民法典》规定，当事人自知道或应当知道撤销事由之日起一年内应行使撤销权；对于重大误解，期限为九十日。超过这些期限，撤销权将消灭。

3. 违约责任：

   • 若双方无法协商一致，且不存在法定撤销事由，单方撤销合同将可能构成违约。此时，违约方需承担相应的违约责任，包括赔偿对方因此遭受的损失等。

4. 实际操作建议：

   • 在考虑撤销合同前，务必仔细审查合同条款及相关法律法规，确保自己的主张有充分的法律依据。
   • 若决定撤销合同，应尽快与对方沟通协商，并保留好所有相关证据（如合同文本、聊天记录、交易记录等），以便在必要时向法院或仲裁机构提供证据支持。

综上所述，光伏房顶租赁合同在电站已运行、租金已收取的情况下能否撤销，需根据具体情况来判断。若存在法定撤销事由或双方协商一致，则有可能撤销合同；否则，单方撤销将可能构成违约。因此，在做出决定前，请务必谨慎考虑并咨询专业律师的意见。