工程款支付证书盖假章并不一定无效，其法律效力需结合具体情况来判断。

首先，我们要明确的是，工程款支付证书作为工程款项支付的重要依据，其上的印章真伪直接关系到该证书的真实性和合法性。然而，是否盖有假章就必然导致支付证书无效，这并非一个绝对的结论。

1. 若假章的使用构成表见代理：

   • 在某些情况下，即使印章是假的，但如果相对方有理由相信该印章代表真实意思，且该相信是合理的，那么这种行为可能构成表见代理。
   • 在表见代理的情况下，尽管印章是假的，但支付证书可能仍然被视为有效，因为相对方是基于对印章真实性的合理信赖而做出的行为。

2. 若假章的使用构成欺诈或伪造：

   • 如果使用假章的行为被认定为欺诈或伪造，那么该支付证书很可能被认定为无效。
   • 在这种情况下，由于印章的虚假性直接影响了支付证书的真实性和合法性，因此支付证书将不能作为有效的支付依据。

3. 考虑其他相关因素：

   • 除了印章的真伪外，还需要考虑支付证书的其他内容是否真实、合法，以及是否存在其他影响支付证书效力的因素。
   • 例如，如果支付证书上的金额、支付条件等关键条款存在争议或不明确，那么即使印章是真实的，支付证书的效力也可能受到质疑。

综上所述，工程款支付证书盖假章并不一定无效，其法律效力需结合具体情况来判断。在处理此类纠纷时，应综合考虑印章的真伪、相对方的合理信赖、支付证书的其他内容以及相关法律法规的规定等因素。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。