工程造价材料没有质证，出具的鉴定意见书不能作为认定案件事实的依据。以下是详细分析：

一. 鉴定材料质证的重要性

• 鉴定材料是鉴定意见的基础，如果材料未经质证，其真实性和合法性无法得到确认。
• 根据《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释(一)》第三十四条，法院或仲裁机构应当组织当事人就未经质证的材料进行质证，经质证认为不能作为鉴定依据的，根据该材料作出的鉴定意见不得作为认定案件事实的依据。

二. 对鉴定意见书的影响

• 如果鉴定机构将未经质证的材料作为鉴定依据，那么出具的鉴定意见书在合法性上存在瑕疵。
• 这样的鉴定意见书在诉讼或仲裁程序中可能会被对方当事人质疑，甚至被法院或仲裁机构不予采纳。

三. 实践中的操作建议

• 在涉及工程造价鉴定的案件中，当事人应当积极参与鉴定材料的质证过程，确保材料的真实性和合法性。
• 如果发现鉴定机构使用了未经质证的材料，应当及时提出异议，并要求重新进行鉴定。

我建议：在工程造价鉴定过程中，当事人应当密切关注鉴定材料的质证情况，确保所有材料都经过充分的质证和确认。如果发现鉴定机构存在使用未经质证材料的情况，应当及时采取措施维护自己的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。