网商银行逾期90天后还款并非优先抵扣本金。以下是对此问题的详细分析：
一. 法律与合同规定
法律规定：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，借款人在未按照约定的期限返还借款时，不仅需要按照约定或者国家有关规定支付逾期利息（第六百七十六条），还应当按照约定的期限支付利息（第六百七十四条）。这意味着，在返还借款时，除本金外，利息和逾期利息也是必须支付的。
合同约定：
- 具体的还款顺序和扣款方式通常会在借款人与网商银行签订的借款合同中明确约定。如果合同中没有明确约定，则应遵循法律规定的顺序进行偿还。
二. 逾期还款的扣款顺序
一般顺序：
- 在实践中，如果借款合同中未明确约定偿还顺序，通常优先偿还利息，再还本金。这是因为利息是借款人因使用资金而需支付给贷款人的报酬，是资金使用的成本。
特殊情况下的顺序：
- 根据《商业银行信用卡业务监督管理办法》的相关规定，对于逾期后的还款顺序有明确规定：“逾期1-90天（含）的，先利息或各项费用、后本金的顺序；逾期91天以上的，按照先本金、后利息或各项费用的顺序。”但请注意，这一规定是针对信用卡业务的，对于网商银行的具体贷款产品，可能需要根据其借款合同和相关法律法规来具体判断。
三. 网商银行的具体实践
- 网商银行作为一家合法的金融机构，其逾期还款的扣款顺序会遵循相关法律法规和借款合同的约定。如果合同中没有明确约定，网商银行可能会根据其内部政策和规定来执行扣款顺序。
四. 建议与结论
- 我建议借款人在逾期后，应首先与网商银行进行沟通，了解具体的还款要求和扣款顺序，以避免不必要的法律纠纷和额外费用。
- 结论：网商银行逾期90天后还款并非优先抵扣本金，而是需要按照法律规定和借款合同的约定来执行扣款顺序。借款人应仔细阅读合同条款，了解自己的权益和义务，以便在逾期后能够合理应对。如有进一步需要，您可以继续咨询我。