在职务侵占案件中，被侵权人不一定会申请查每一笔流水。以下是对此问题的详细分析：

1. 被侵权人的诉求与关注点：

   • 被侵权人主要关注的是能否追回被侵占的财产，以及如何让侵权人受到法律的制裁。
   • 他们可能会根据已知的线索或证据，向司法机关提出调查申请，但并不一定要求查每一笔流水。

2. 调查的必要性与效率：

   • 司法机关在处理职务侵占案件时，会根据案件的复杂程度、涉案金额、证据线索等因素，决定是否需要对每一笔流水进行详细调查。
   • 如果案件涉及金额巨大、交易频繁或存在复杂的资金流向，司法机关可能会采取更加全面和细致的调查方式，包括查每一笔流水。
   • 但如果案件相对简单，涉案金额较小，且已有足够的证据指向侵权人，那么司法机关可能会采取更为高效的调查方式，而不必逐一审查每一笔流水。

3. 被侵权人的申请与司法机关的决定：

   • 被侵权人可以向司法机关提出申请，要求调查特定的流水或交易记录，但这并不意味着司法机关会完全按照被侵权人的要求进行调查。
   • 司法机关会根据法律规定和案件实际情况，独立作出调查决定，并依法开展调查工作。

综上所述，被侵权人在职务侵占案件中不一定会申请查每一笔流水。他们更关注的是能否追回被侵占的财产和让侵权人受到法律制裁，而具体的调查方式和范围则由司法机关根据案件实际情况来决定。如有进一步需要，您可以继续咨询我。