对于你提到的“个人所得税出现两份工资，一份是个人工资，一份是不明工资，是否可以起诉不明工资单位”的问题，首先可以明确的是，你可以采取一定的法律措施来查明并处理这份不明工资。

1. 向税务部门查询并举报：

   • 你应当首先向当地税务部门进行查询，了解这份不明工资的具体情况，包括发放单位、发放时间等。
   • 如果确认这份工资并非你所得，且存在偷税、漏税等违法行为，你可以向税务部门进行举报。税务部门将会对此进行调查，并根据调查结果采取相应的法律措施。

2. 向劳动部门反映情况：

   • 除了税务部门，你也可以向当地劳动部门反映这一情况。劳动部门可以帮助你查明这份不明工资的来源，并协调解决可能存在的劳动纠纷。

3. 法律途径维护权益：

   • 如果经过查询和举报后，问题仍未得到解决，或者这份不明工资对你的合法权益造成了侵害，你可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。例如，你可以咨询律师，了解具体的法律程序和诉讼途径。

4. 注意事项：

   • 在处理这一问题的过程中，你应当保留好相关的证据材料，如个人所得税缴纳记录、银行流水等，以便在需要时提供证明。
   • 同时，你也应当注意保护自己的个人信息和隐私，避免泄露不必要的个人信息。

综上所述，对于个人所得税中出现的不明工资，你可以通过向税务部门查询并举报、向劳动部门反映情况以及通过法律途径维护权益等方式来处理。如果你在这一过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。