男方签离婚协议书后发现女儿不是亲生，确实可以起诉。具体来说：

1. 起诉的法律依据：

   • 从身份关系上看，亲生父母与子女之间存在法定的权利义务关系。男方抚养非亲生子女，其情感和精力付出未得到应有回报，有权基于这一事实提起诉讼。
   • 在财产方面，男方在婚姻存续期间抚养非亲生子女产生了额外支出，这影响了夫妻共同财产分配的公平性。男方可以夫妻感情破裂为由起诉离婚后财产纠纷，要求女方返还抚养费，并在财产分割上适当多分。

2. 起诉的诉求：

   • 男方可以要求女方返还婚姻关系存续期间男方付出的扶养费。
   • 男方还可以要求精神抚慰金，以补偿其因抚养非亲生子女而承受的精神痛苦。法院会综合考虑过错程度、损害后果及双方经济状况，酌情判定。

3. 起诉的程序与证据：

   • 男方需要撰写起诉状，明确诉讼请求和事实与理由，并提交给有管辖权的人民法院。
   • 男方应提供充分的证据来支持其诉讼请求，包括但不限于亲子鉴定报告、抚养费支出凭证、结婚证、离婚证等。

4. 可能的法律后果：

   • 如果法院认定男方的诉讼请求成立，女方可能需要返还扶养费，并支付精神抚慰金。
   • 法院还会结合抚养时间长短、支出数额等具体情况，对夫妻共同财产进行重新分配，以维护男方的合法权益。

总之，男方在签离婚协议书后发现女儿不是亲生的情况下，有权向法院提起诉讼，要求女方承担相应的法律责任。在起诉前，男方应收集充分的证据来支持其诉讼请求，并咨询专业律师以获取更具体的法律建议。