被告人缺席时，法院的判决方式会根据案件的具体情况和法律规定有所不同。以下是对此问题的详细解答：
一、刑事案件中被告人缺席的判决
普通程序：
- 在刑事诉讼的普通程序中，如果被告人经依法传唤无正当理由拒不到庭，法院一般不会直接进行缺席审判，因为刑事诉讼涉及对被告人的人身自由甚至生命权的剥夺，必须确保被告人的诉讼权利得到充分保障。
- 如果被告人因逃避审判而长期潜逃在外，导致案件无法及时审结，法院可能会采取中止审理或公告送达等措施，待被告人到案后再恢复审理。
特殊程序（如贪污贿赂犯罪、严重危害国家安全犯罪、恐怖活动犯罪）：
- 对于这类重大犯罪案件，在符合一定条件下（如犯罪嫌疑人、被告人在境外，且监察机关、公安机关已移送起诉，人民检察院认为犯罪事实已经查清、证据确实充分等），法院可以适用缺席审判程序。
- 缺席审判程序会由犯罪地、被告人离境前居住地或者最高人民法院指定的中级人民法院组成合议庭进行审理，并依法保障被告人的诉讼权利。
- 若经审理认定被告人有罪，法院将作出有罪判决；若证据不足或不能认定被告人有罪的，则作出无罪判决。
自诉案件：
- 在自诉案件中，如果被告人下落不明，法院通常会说服自诉人撤回起诉，或者裁定驳回起诉，因为自诉人需要承担举证责任，在被告人缺席的情况下往往难以完成举证任务。
二、民事案件中被告缺席的判决
- 在民事诉讼中，如果被告经传票传唤无正当理由拒不到庭，或者未经法庭许可中途退庭，法院可以缺席判决。
- 法院在缺席判决时会根据原告提供的证据和诉讼请求进行审查，如果原告提供的证据足以证明其主张的事实成立且符合法律规定，法院将支持原告的诉讼请求并作出相应判决。
- 被告对缺席判决不服的，可以在规定的时间内提起上诉，二审法院将对案件进行全面审查并作出裁定。
综上所述，被告人缺席时法院的判决方式需根据案件类型和具体情况而定。在刑事案件中，普通程序通常不会缺席审判，但特殊程序下可以；在民事案件中，被告缺席时法院可以依据原告提供的证据进行缺席判决。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。