公司搬迁仲裁申请书应该写新的公司地址，而不是注册地。以下是详细的分析和解释：

1. 从实际履行地角度考虑：

   • 公司搬迁后，实际的经营地、员工的合同履行地都发生了变更。因此，在提起仲裁时，应当针对公司当前的实际经营地，即新的公司地址进行申请。
   • 如果仍然按照注册地来申请，可能会导致仲裁机构无法准确送达文书，或者公司提出管辖权异议，从而延误仲裁进程。

2. 从法律条文角度考虑：

   • 根据《劳动争议调解仲裁法》等相关法律法规，劳动争议由劳动合同履行地或者用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会管辖。公司搬迁后，劳动合同履行地和用人单位所在地实际上都已经变更为新的公司地址。
   • 因此，从法律条文的角度来看，也应当选择新的公司地址作为仲裁申请的对象。

3. 从实践操作角度考虑：

   • 在实际操作中，仲裁机构通常会根据公司的实际经营地来确定管辖权。如果公司已经搬迁，但仲裁申请书仍然写的是注册地，那么仲裁机构可能会要求申请人进行补正或者驳回申请。
   • 为了避免不必要的麻烦和延误，申请人在提起仲裁时应当直接写明公司的新的地址。

综上所述，公司搬迁仲裁申请书应该写新的公司地址，而不是注册地。这样做既符合实际履行地的原则，也符合法律条文的规定，同时也有利于仲裁程序的顺利进行。如果你还有其他关于劳动仲裁的问题，可以直接向我咨询。