关于事业单位女职工怀孕期间是否影响年底奖金绩效待遇，以及如果有人代岗绩效应该如何分配的问题，以下是我的详细解答：

首先，结论上，女职工怀孕期间通常不应影响其年底奖金绩效待遇，但具体还需根据单位的具体规定和实际情况来判断。

1. 女职工怀孕期间的权益保护：

   • 根据相关法律法规，女职工在怀孕期间享有特殊的劳动保护，包括但不限于不得安排其从事国家规定的第三级体力劳动强度的劳动和孕期禁忌从事的劳动，对怀孕7个月以上的女职工，不得安排其延长工作时间和夜班劳动。
   • 这些规定旨在保护女职工的身体健康和胎儿的正常发育，但并未直接涉及年底奖金绩效待遇的问题。

2. 年底奖金绩效待遇的确定：

   • 年底奖金绩效通常是根据员工的工作表现、工作成果以及单位的经营状况等多方面因素来综合确定的。
   • 女职工怀孕期间的工作表现和工作成果，如果符合单位的考核标准，那么她就有权获得相应的年底奖金绩效。

3. 代岗情况下的绩效分配：

   • 如果女职工因怀孕需要休息或调整工作岗位，单位可能会安排其他员工代岗。
   • 在这种情况下，代岗员工的绩效应该根据其实际完成的工作量和工作成果来单独考核，而不应直接与怀孕女职工的绩效挂钩。
   • 怀孕女职工的绩效则应根据她实际参与的工作和贡献来评定，不应因代岗而受到影响。

4. 单位规定的考虑：

   • 不同的事业单位可能有不同的年底奖金绩效评定规定。
   • 因此，在具体操作时，还需参考单位的相关规定，以确保公平、公正地处理这一问题。

综上所述，事业单位女职工怀孕期间的年底奖金绩效待遇通常不应受到影响，且在有代岗情况下，绩效应分别根据怀孕女职工和代岗员工的实际贡献来评定。如果在这方面遇到任何问题或争议，建议及时与单位的人事部门沟通，并寻求专业的法律咨询。